Генотипическая принадлежность изолятов вируса бычьего лейкоза, циркулирующих в популяциях крупного рогатого скота Республики Татарстан
Автор: Гильманов Х.Х., Вафин Р.Р., Шаева А.Ю., Закирова З.Р., Тюлькин С.В.
Статья в выпуске: 3 т.235, 2018 года.
Бесплатный доступ
Вирус бычьего лейкоза (ВБЛ) - этиологический агент лейкоза крупного рогатого скота, наносящего существенный экономический ущерб отрасли скотоводства. Молекулярно-генетические методы исследования являются наиболее информативными инструментами его геноидентификации, при этом современная филогенетическая классификация ВБЛ предусматривает наличие десяти генотипов возбудителя, Целью исследования являлось установление генотипической принадлежности изолятов ВБЛ, циркулирующих в популяциях крупного рогатого скота Республики Татарстан, используя филогенетический анализ секвенированных последовательностей локуса env-гена провируса и ПЦР-ПДРФ-анализ, согласующийся с филогенетической классификацией изучаемого вирусного патогена. В результате исследования установлено, что в популяциях крупного рогатого скота Республики Татарстан циркулируют изоляты 1 -го, 4-го, 7-го и 8-го генотипов ВБЛ, Предложенная в соответствии с филогенетической классификацией стратегия ПЦР-ПДРФ-генотипирования ВБЛ, актуализирована с учетом новых знаний о генетическом разнообразии возбудителя, и позволяет проводить идентификацию всех десяти известных генотипов изучаемого инфекционного агента.
Вбл, генотип, идентификация, пцр, пдрф, секвенирование, филогенетический анализ
Короткий адрес: https://sciup.org/142216819
IDR: 142216819 | УДК: 619:57.065:578.828 | DOI: 10.31588/2413-4201-1883-235-3-34-40
Genotypic identity of bovine leukemia virus isolates, circulating in livestock populations of the Republic of Tatarstan
The bovine leukemia virus (BLV) is the etiological agent of bovine leukosis, which causes significant economic damage to the livestock sector. Molecular genetic methods of investigation are the most informative tools for its genotype identification, while the modern phylogenetic classification of BLV provides for the presence of ten genotypes of the pathogen. The aim of the study was to establish the genotypic identity of BLV isolates circulating in livestock populations of the Republic of Tatarstan, using a phylogenetic analysis of the envgene provirus sequences and PCR-RFLP-analysis, consistent with the phylogenetic classification of the studied viral pathogen. As a result of the study, it was found that the isolates of the 1st, 4th, 7th and 8th genotypes of BLV circulate in livestock populations of the Republic of Tatarstan. The strategy of PCR-RFLP-genotyping of BLV, proposed in accordance with the phylogenetic classification, was updated taking into account new knowledge of the genetic diversity of the pathogen, and allows identification of all ten known BLV genotypes
Список литературы Генотипическая принадлежность изолятов вируса бычьего лейкоза, циркулирующих в популяциях крупного рогатого скота Республики Татарстан
- Вафин, Р.Р. Выявление нового (8-го) генотипа ВЛКРС в различных регионах мира/Р.Р. Вафин, Н.З. Хазипов, А.Ю. Шаева, З.Р. Закирова, Л.И. Зайнуллин, С.В. Тюлькин, И.Р. Абдулина, А.М. Алимов//Фундаментальные исследования. -2013. -№ 10 (часть 7). -С. 1467-1471
- Вафин, Р.Р. Генотипическая идентификация вируса бычьего лейкоза/Р.Р. Вафин, Н.З. Хазипов, А.Ю. Шаева, З.Р. Закирова, Л.И. Зайнуллин, С.В. Тюлькин, И.Р. Абдулина, А.М. Алимов//Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. -2014. -№ 4. -С. 34-40
- Хазипов, Н.З. Геноидентификация вируса бычьего лейкоза: монография/Н.З. Хазипов, Р.Р. Вафин, А.Ю. Шаева, З.Р. Закирова, А.М. Алимов, Г.Ф. Кабиров//М.: ИНФРА-М, 2017. -163с.
- Шаева, А.Ю. Генотипическая идентификация изолятов ВЛКРС, выявленных в хозяйствах Республики Татарстан/А.Ю. Шаева, Р.Р. Вафин, Н.З. Хазипов, Б.В, Камалов, А.М. Алимов, М.Ш. Тагиров//Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной ме дицины им. Н.Э. Баумана. -2011. -Т. 208. -С. 330-337
- Шаева, А.Ю. Идентификация нового генотипа ВЛКРС/А.Ю. Шаева, З.Р. Гараева, Р.Р. Вафин, Н.З. Хазипов, А.М. Алимов//Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана. -2012. -Т. 211. -С. 192-197
- Balic, D. Identification of a new genotype of bovine leukemia virus/D. Balic, l. Lojkic, M. Periskic, T. Bedekovic, A. Jungic, N. Lemo, B. Roic, Z. Cac, L. Barbie, J. Madic//Arch. Virol. -2012. -V. 157. -N. 7. -P. 1281-1290.
- Beier, D. Identification of different BLV provirus isolates by PCR, RFLPA and DNA sequencing/D. Beier, P. Blankenstein, O. Marquardt, J. Kuzmak//Berl. Munch. Tierarztl. Wochenschr. -2001. -V. 114. -N. 7-8. -P. 252-256
- Fechner, H. Provirus variants of the bovine leukemia virus and their relation to the serological status of naturally infected cattle/H. Fechner, P. Blankenstein, A.C. Looman, J. Elwert, L. Geue, C. Albrecht, A. Kurg, D. Beier, O. Marquardt, D. Ebner//Virology. -1997. -V. 237. -N. 2. -P. 261-269
- Lee, E. Molecular epidemiological and serological studies of bovine leukemia virus (BLV) infection in Thailand cattle/E. Lee, E.J. Kim, J. Ratthanophart, R. Vitoonpong, B.H. Kim, I S. Cho, J.Y. Song, K.K. Lee, Y.K. Shin//Infect. Genet. Evol. -2016. -V. 41. -N. 245-254.
- Licursi, M. Genetic heterogeneity among bovine leukemia virus genotypes and its relation to humoral responses in hosts/M. Licursi, Y. Inoshima, D. Wu, T. Yokoyama, E.T. Gonzâlez, H. Sentsui//Virus Res. -2002. -V. 86. -N. 1-2. -P. 101-110
- Polat, M. A new genotype of bovine leukemia virus in South America identified by NGS-based whole genome sequencing and molecular evolutionary genetic analysis/M. Polat, S.N. Takeshima, K. Hosomichi, J. Kim, T. Miyasaka, K. Yamada, M. Arainga, T. Murakami, Y. Matsumoto, V. de la Barra Diaz, C.J. Panei, ET. Gonzâlez, M. Kanemaki, M. Onuma, G. Giovambattista, Y. Aida//Retrovirology. -2016. -V. 13. -N. 4. -P. 2289-2291
- Rodriguez, S.M. Bovine leukemia virus can be classified into seven genotypes: evidence for the existence of two novel clades/S.M. Rodriguez, M.D. Golemba, R.H. Cam pos, K. Trono, L.R. Jones//J. Gen. Virol. -2009. -V. 90. -N. 11. -P. 2788-2797
- Rola-Łuszczak, M. The molecular characterization of bovine leukaemia virus isolates from Eastern Europe and Siberia and its impact on phylogeny/M. Rola-Łuszczak, A. Pluta, M. Olech, I. Donnik, M. Petropavlovskiy, A. Gerilovych, I. Vinogradova, B. Choudhury, J. Kuźmak//PLoS One. -2013. -V. 8. -N. 3. -P.58705
