Использование чисел Хилла для оценки видового и таксономического разнообразия в группах местообитаний
Автор: Шитиков Владимир Киррилович, Зинченко Татьяна Дмитриевна
Журнал: Принципы экологии @ecopri
Рубрика: Методы экологических исследований
Статья в выпуске: 3 (7) т.2, 2013 года.
Бесплатный доступ
Рассматривается семейство параметрических показателей видового и таксономического разнообразия, основанное на оценках «эффективного количества видов» или числах Хилла. Обсуждаются их отличия от других индексов разнообразия, использующих формулу энтропии Шеннона или иное выражение. Приводится способ разделения общего γ-разнообразия на α- и β-компоненты. Описана методика расчета матрицы таксономических расстояний и формирования филогенетического дерева на основе линнеевской систематики. Рассматривается динамика изменения индексов видового и таксономического разнообразия по продольному профилю водотока на примере донных сообществ средней равнинной реки Сок (приток Саратовского водохранилища). Описаны алгоритмы проверки статистической значимости отличий индексов разнообразия при сравнении двух или более групп местообитаний, основанные на рандомизационных процедурах.
Энтропия шеннона, числа хилла, таксономическое разнообразие, разложение разнообразия, сравнение групп, рандомизация, сообщества макрозообентоса, продольный профиль реки
Короткий адрес: https://sciup.org/147112686
IDR: 147112686
Список литературы Использование чисел Хилла для оценки видового и таксономического разнообразия в группах местообитаний
- Особенности пресноводных экосистем малых рек Волжского бассейна [Small rivers in the Volga basin: freshwater ecosystems сharacteristics]/Под редакцией Розенберга Г.С., Зинченко Т.Д. Тольятти: Кассандра, 2011. 322 с.
- Розенберг Г. С. Информационный индекс и разнообразие: Больцман, Котельников, Шеннон, Уивер… [Information index and diversity: Boltzmann, Kotelnikov, Shannon, Weaver…]//Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии. 2010. Т. 19, № 2. С. 4-;25.
- Шитиков В. К., Зинченко Т. Д. Изменение индексов таксономического разнообразия сообществ макрозообентоса по продольному градиенту рек [Variation of taxonomic diversity indices of macrozoobenthos community along river gradient]//Принципы экологии. 2013. № 2. С. 46-;56.
- Шитиков В. К., Розенберг Г. С. Рандомизация и бутстреп: статистический анализ в биологии и экологии с использованием R. [Randomization and bootstrap: statistical analysis in biology and ecology with using R] Тольятти: Кассандра, 2013. 314 с. URL: http://www.ievbras.ru/ecostat/Kiril (дата обращения: 20.12.2013).
- Chao A., Chiu C.-H., Jost L. Phylogenetic diversity measures based on Hill numbers//Philos. Trans. R. Soc. Lond. Ser. B -; Biol Sci. 2010. N 365. Р. 3599-;3609.
- Crozier R.H. Preserving the information content of species: genetic diversity, phylogeny, and conservation worth//Annu. Rev. Ecol. Syst. 1997. V. 28. P. 243-;268.
- De'ath G. The multinomial diversity model: linking Shannon diversity to multiple predictors//Ecology. 2012. V. 93, N 10. P. 2286-;2296.
- Hill M. O. Diversity and evenness: A unifying notation and its consequences//Ecology. 1973. V. 54. P. 427-;431.
- Hurlbert S. The Nonconcept of species diversity: A critique and alternative parameters//Ecology. 1971. V. 52. P. 577-;586.
- Jost L. Entropy and diversity//Oikos. 2006. V. 113. P. 363-;375.
- Jost L. Partitioning diversity into independent alpha and beta components//Ecology. 2007. V. 88, N 10. P. 2427-;2439.
- MacArthur R. H. Patterns of species diversity//Biol. Rev. 1965. V. 40. P. 510-;533.
- Magurran A.E. Measuring Biological Diversity. 2nd ed. Oxford: Blackwell Publ., 2004. 260 p.
- Pallmann P., Schaarschmidt F., Hothorn L. et al. Assessing group differences in biodiversity by simultaneously testing a user-defined selection of diversity indices//Mol. Ecol. Resour. 2012. V. 12, N 6. P. 1068-;1078.
- R Development Core Team. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. Vienna, Austria, 2012. URL: http://www.R-project.org (accessed 5/28/2013).
- Renyi A. On measures of entropy and information/Proc. 4th Symp. Math. Statist. Probabil. Berkeley: Univ. of California Press, 1961. P. 547-;561.
- Ricotta C., Avena G. C. An information-theoretical measure of taxonomic diversity//Acta Biotheor. 2003. V. 51. P. 35-;41.
- Ricotta C., Szeidl L. Towards a unifying approach to diversity measures: bridging the gap between the Shannon entropy and Rao's quadratic index//Theor. Popul. Biol. 2006. V. 70. Р. 237-;243.
- Vane-Wright R. I., Humphries C. J., Williams P.M. What to protect: systematics and the agony of choice//Biol. Conserv. 1991. V. 55. P. 235-;254.
- Shannon C. E., Weaver W. The Mathematical Theory of Communication. Urbana: Univ. Illinois Press, 1949. 117 p.
- Tuomisto H. A diversity of beta diversities: straightening up a concept gone awry. P. 1. Defining beta diversity as a function of alpha and gamma diversity//Ecography. 2010a. V. 33. P. 2-;22.
- Tuomisto H. A diversity of beta diversities: straightening up a concept gone awry. P. 2. Quantifying beta diversity and related phenomena//Ecography. 2010b. V. 33. P. 23-;45.
- Tuomisto H. Commentary: Do we have a consistent terminology for species diversity? Yes, if we choose to use it//Oecologia. 2011. V. 167. P. 903-;911.
