Молекулярно-генетическое тестирование гольца по гипервариабельным локусам генома
Автор: Четвертакова Елена Викторовна, Заделенов Владимир Анатольевич, Алексеева Елена Александровна, Заделенова Анна Владимировна, Денисенко Елена Александровна
Журнал: Вестник Красноярского государственного аграрного университета @vestnik-kgau
Рубрика: Ветеринария и зоотехния
Статья в выпуске: 12, 2022 года.
Бесплатный доступ
Цель работы - подтверждение видовой принадлежности гольцов, обитающих в озере Мелкое. Задачи исследования: вылов гольцов в оз. Мелкое, взятие биоматериала для ПЦР-теста, определение фрагментов ДНК, характерных для вида. Вылов гольцов проводился на оз. Мелкое бассейна реки Пясины в сентябре-октябре 2022 г. ставными жилковыми сетями с ячеей 30-55 мм, длиной 30 м и высотой в посадке 2 м на глубинах от 9 до 14 м. Время экспозиции 12 часов. Температура воды - 6-7 °С. Биоматериал (мышцы хребта) в количестве семи образцов (в двух повторностях) был зафиксирован в 95 %-м этаноле, реакция проводилась в лаборатории АО «Красноярскагроплем». Перед выделением ДНК мышечную ткань вымачивали в буферном растворе трис-гидрохлорида. Для выделения ДНК из образцов биоматериала использовали набор реагентов «Экстран-2» производства фирмы ООО «НПФ Синтол», Россия. Для получения ISSR-фрагментов ДНК были использованы микросателлитные инвертированные праймеры (CTC)6G - CTC-CTC-CTC-CTC-CTC-CTC-G; (AGC)6G - AGC-AGC-AGC-AGC-AGC-AGC-G; (GAG)6C - GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-GAG-C;(ACC)6G - ACC-ACC-ACC-ACC-ACC-ACC-G. ПЦР проводили в режиме горячий старт - 3 мин/95 °С. Далее 35 циклов в режиме: 1 мин/94 °С - денатурация; отжиг праймеров - 1 мин/60 °С; синтез ДНК - 1 мин/72 °С; достройка - 5 мин/72 °С. Результаты молекулярно-генетического анализа свидетельствуют, что распределение длин и частота встречаемости фрагментов ДНК являются характерными признаками генома гольца. Специфическими для гольца Дрягина являются фрагменты ДНК длиной от 200 до 1050 п.н. Полученные результаты будут использованы для определения видовой систематической принадлежности гольца при внедрении в аквакультуру Красноярского края.
Голец дрягина, молекулярно-генетическое тестирование, геном, днк, полимеразная цепная реакция, ядерная днк
Короткий адрес: https://sciup.org/140297189
IDR: 140297189 | DOI: 10.36718/1819-4036-2022-12-175-180
Список литературы Молекулярно-генетическое тестирование гольца по гипервариабельным локусам генома
- Генетическая структура популяций северных оленей о. Колгуев Ненецкого автономного округа / Т.М. Романенко [и др.] // Достижение науки и техники АПК. 2014. №. 4. С. 68-70.
- Голец Дрягина Salvelinus Drjagini Logaschev озера Собачьего (плато Путорана) / В.А. Заделенов [и др.] // Рыболовство и рыбное хозяйство. 2022. № 10. С. 661-672.
- Жвакина А.Р., Ельсукова И.А., Легкобит А.П. Анализ аллелофонда кроликов отечественных пород методом ISSR-PCR // Достижение науки и техники АПК. 2016. Т. 30, № 1. С. 72-74.
- Кол Н.В., Лазебный О.Е. Полиморфизм ISSR-PCR-маркеров в тувинской популяции северного оленя // Генетика. 2006. Т. 42. С. 1731-1734.
- Логашев М.В. Озеро Мелкое и его рыбохозяйственное использование // Тр. Института полярного земледелия, животноводства и промыслового хозяйства. Сер. Промысловое хозяйство. 1940. № 11. С. 7-72.
- Тимошкина Н.Н., Водолажский Д.И., Усатов А.В. Молекулярно-генетические маркеры в исследовании внутри- и межвидового полиморфизма осетровых рыб (Acipenseriformes) // Экологическая генетика. 2010. Т. 8. №. 1. С. 12-24.
- Hartley S.E., Davidson W.S. Distribution of satellite DNA sequences isolated from Arctic char, Salvelinus alpinus, in the genus Salvelinus // Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. 1994. Т. 51, № S1. С. 277-283.
