Статьи журнала - Вестник Пермского университета. Серия: Биология

Все статьи: 857

Филин Bubo bubo (L.) в Волжско-Камском крае

Филин Bubo bubo (L.) в Волжско-Камском крае

Шепель Александр Иванович

Статья научная

Представлены результаты анализа литературных сведений и собственных материалов по численности, распространению, биотопической приуроченности, характеру пребывания, особенностям гнездования, размножению, питанию, лимитирующим факторам и охране одной из самых редких видов сов региона - филина, занесенного практически во все Красные книги. Рассмотрены территории 14 субъектов Российской Федерации, входящих в Приволжский федеральный округ (Волжско-Камский край) за более чем столетний период, со времен исследований Э.А. Эверсманна (1866) до первого десятилетия ХХI в.

Бесплатно

Филогенетическое положение галотолерантного штамма Brevibacterium sp. U1, выделенного из засоленной почвы, в системе рода Brevibacterium

Филогенетическое положение галотолерантного штамма Brevibacterium sp. U1, выделенного из засоленной почвы, в системе рода Brevibacterium

Ананьина Людмила Николаевна

Статья научная

Исследовано филогенетическое положение галотолерантного штамма Brevibacterium sp. U1, выделенного ранее из почвы района промышленной соледобычи (г. Березники, Пермский край), в системе рода Brevibacterium на основе анализа нуклеотидных последовательностей ect-генов, кодирующих ферменты биосинтеза осмопротекторного вещества - этоина, и 16S рДНК. Анализ нуклеотидных последовательностей генов ectB и ectC согласовался с результатами анализа 16S рДНК. Однако было выявлено значительное эволюционное расстояние нуклеотидных последовательностей ectC-гена штамма Brevibacterium sp. U1 от филогенетически близкородственного вида B. aurantiacum.

Бесплатно

Филогенетическое разнообразие бактерий в каменной соли Верхнекамского месторождения (Пермский край)

Филогенетическое разнообразие бактерий в каменной соли Верхнекамского месторождения (Пермский край)

Пьянкова А.А., Белоглазова Ю.А., Корсакова Е.С., Бачурин Б.А., Плотникова Е.Г.

Статья научная

С использованием молекулярно-генетических методов получены новые данные о филогенетическом разнообразии бактерий в галогенных отложениях Верхнекамского месторождения солей (Пермский край). Анализ генов 16S рРНК, обнаруженных в тотальной ДНК образца каменной соли (глубина отбора 239.7-239.8 м), позволил установить присутствие бактерий, принадлежащих классам Actinobacteria (близкородственных родам Rhodococcus, Demequina), Gammaproteobacteria (родам Pseudomonas, Serratia, Shigella), Betaproteobacteria (роду Ralstonia) и Alphaproteobacteria (роду Phyllobacterium). Кроме того, выявлены два филотипа класса Alphaproteobacteria (клон 66ВА (GenBank MH410136) и клон 12ВА (GenBank MH410128), проявляющие низкий уровень сходства по генам 16S рРНК (98.46%) с ближайшими типовыми штаммами рода Mesorhizobium ( M. alhagi CCNWXJ12-2T) и рода Chelativorans ( C. multitrophicus DSM9103T), которые могут представлять новые таксономические единицы.

Бесплатно

Филогенетическое разнообразие бактерий семейства Micrococcaceae, выделенных из биотопов с различным антропогенным воздействием

Филогенетическое разнообразие бактерий семейства Micrococcaceae, выделенных из биотопов с различным антропогенным воздействием

Ястребова О.В., Плотникова Е.Г.

Статья научная

Проанализированы данные по систематической принадлежности и распространению бактерий сем. Micrococcaceae, выделенных из экосистем с различной степенью антропогенной нагрузки (г. Пермь, Березники, Соликамск, Оса; Пермский край). Показано филогенетическое разнообразие и широкое распространение представителей семейства Micrococcaceae в различных биотопах района разработок Верхнекамского месторождения солей. Разнообразие видов бактерий семейства Micrococcaceae выявлено в почве и ризосфере растений, произрастающих вблизи солеотвалов. На основании анализа гена 16S рРНК исследуемые штаммы семейства Micrococcaceae были отнесены к семи родам: Arthrobacter, Pseudoarthrobacter, Glutamicibacter, Micrococcus, Kocuria, Nesterenkonia, Rothia. Исследуемые культивируемые бактерии семейства Micrococcaceae, выделенные из экотопов с экстремальными условиями среды, являются перспективными для дальнейшего их использования в биотехнологических целях.

Бесплатно

Филогенетическое разнообразие бактерий, выделенных из ризосферы мари красной (Chenopodium rubrum L.), произрастающей в условиях засоления на территории солеразработок (г. Соликамск, Пермский край)

Филогенетическое разнообразие бактерий, выделенных из ризосферы мари красной (Chenopodium rubrum L.), произрастающей в условиях засоления на территории солеразработок (г. Соликамск, Пермский край)

Корсакова Е.С., Пьянкова А.А., Назаров А.В.

Статья научная

В ризосфере мари красной (Chenopodium rubrum L.), произрастающей в районе промышлен­ных солеразработок (г. Соликамск, Пермский край), выявлено большое разнообразие бакте­рий различных филогенетических групп. Значительный массив прокариот представлен гра-мотрицательными умеренно галофильными бактериями класса Gammaproteobacteria, а также грамположительными галотолерантными бактериями класса Actinobacteria. Кроме того, в об­разцах ризосферы обнаружены бактерии класса Bacilli филума Firmicutes и класса Flavobacteriia филума Bacteroidetes.

Бесплатно

Фиторегулирующее действие продуктов бактериальной деструкции парацетамола

Фиторегулирующее действие продуктов бактериальной деструкции парацетамола

Коротаев М.Ю., Вихарева Е.В., Белоногова В.Д., Ившина И.Б.

Статья научная

Показано, что продукты биодеструкции парацетамола клетками Rhodococcus ruber ИЭГМ 77 име-ют гуминоподобную природу. В составе их молекул присутствуют “симметричные” и “асиммет-ричные” участки, включающие аминофенольные, феноксазиновые, индольные и бензофурановые фрагменты. В основе химической структуры данных фрагментов лежат замещенные ароматиче-ские или хиноидные циклы с пара- (“симметричным”) и мета- (“асимметричным”) положениями эквивалентных заместителей - фенольных гидроксильных или азотсодержащих функциональных групп. Выявлено фиторегулирующее действие продуктов бактериальной деструкции парацетамола на прорастание семян пшеницы мягкой Triticum aestivum L., обусловленное влиянием “симметрич-ных” и “асимметричных” молекулярных участков на функциональную активность пероксидазы. Экспериментально обосновано, что эффект фитостимуляции зависит от стадии роста растения и концентрации веществ, содержащихся в водном извлечении из продуктов бактериальной деструк-ции парацетамола.

Бесплатно

Фитосанитарное состояние еловых насаждений на территории Частинского участкового лесничества

Фитосанитарное состояние еловых насаждений на территории Частинского участкового лесничества

Бойко Татьяна Алексеевна, Лысьева Юлия Сергеевна

Статья научная

В 2014-2017 гг. изучено фитосанитарное состояние елового насаждения Частинского участкового лесничества Осинского лесничества Пермского края. Объектом исследования явились защитные леса, относящиеся к лесорастительной зоне хвойно-широколиственных лесов. Древостои представлены приспевающими и спелыми насаждениями ельника-зеленомошника, ельника-кисличника и ельника-липнякового преимущественно II класса бонитета. Тип лесорастительных условий В2 и С2. В насаждениях преобладает ель сибирская - 54%, пихта сибирская занимает 23%, менее 10% составляют сосна обыкновенная, липа мелколистная, осина и береза повислая. Для спелых и перестойных насаждений характерно наличие повреждений; чаще встречаются морозные трещины и дупла, реже - искривление ствола, отслоение коры, наличие плодовых тел и усохших скелетных ветвей. Санитарное состояние насаждений в разных типах леса показало тенденцию к ухудшению, рассчитанный индекс жизненного состояния кореллирует с категориями санитарного состояния. Даны рекомендации по системе лесохозяйственных мероприятий.

Бесплатно

Фитотестирование почв и техногенных поверхностных образований в урбанизированных ландшафтах

Фитотестирование почв и техногенных поверхностных образований в урбанизированных ландшафтах

Еремченко О.З., Митракова Н.В.

Статья научная

Урбанизированные территории характеризуются глубокой трансформацией почвенного покрова, появлением новых почв и почвоподобных образований, зачастую низкоплодородных и токсичных. Оценка их токсичности и биологической активности является трудоемким процессом. В статье дано обоснование разрабатываемого метода фитотестирования трансформированных почв и почвоподобных образований в техногенных и урбанизированных ландшафтах. Проведен отбор эталона сравнения по реакции тест-культуры, выращенной на природных почвах Пермского края, а также на вермикулите с питательным раствором. Кресс-салат на вермикулите показал наибольшую высоту, массу и наименьшую редокс-активность. Состояние тест-культуры зависит от плодородия, однако даже на плодородных почвах высота и масса были снижены на 30-40% относительно растений на вермикулите. Редокс-активность повышалась при выращивании на пробе из оподзоленного горизонта. При тестировании городских почв установлено снижение массы, высоты растений и повышение редокс-активности относительно контроля.

Бесплатно

Фитотоксичность лежалых отходов цианирования золотосодержащей руды на территории накопленного экологического ущерба

Фитотоксичность лежалых отходов цианирования золотосодержащей руды на территории накопленного экологического ущерба

Артамонова Валентина Сергеевна, Бортникова Светлана Борисовна, Оплеухин Алексей Александрович

Статья научная

Представлены результаты исследований фитотоксичности лежалых отходов цианирования золотосодержащих руд и прилегающих почв на территории накопленного экологического ущерба. Установлено, что они жизнепригодны для овса посевного только в вершинной части старого отвала, но морфометрические показатели корней и ростков обнаруживают эффект торможения; горчица обнаруживает летальный исход во всех пробах. В почвенной среде проявилось ингибирование корней, особенно горчицы, но ростки оказались выше у горчицы. Суммарный вес ростков и корней овса превышал таковой горчицы в 2-3 раза. Показано, что лежалые отвалы жизнеобитаемы, в них присутствуют жизнедеятельные токсобные азотобактерии, отличающиеся от почвенных обитателей. Стратегия роста бактерии направлена на быстрое воспроизводство клеток, но в дальнейшем они быстро теряют подвижность, способность к размножению. Это ограничивает их участие в пополнении среды обитания биогенным азотом и биологически активными веществами. В исследованных отходах и почвах присутствовал схожий набор токсикантов в количестве, превышающем их кларки в земной коре. Для снижения фитотоксичности предлагается проведение планирования отвалов и химической мелиорации техногенной поверхности. Это обеспечит повышение жизнестойкости растений, эффективности сидерации, ускорение формирования биогенности в корнеобитаемом слое, ускорит задернение техногенной поверхности, снизит миграцию экотоксикантов.

Бесплатно

Флора ГПБЗ "Кокманский" (Удмуртская Республика)

Флора ГПБЗ "Кокманский" (Удмуртская Республика)

Баранова Ольга Германовна

Статья научная

Подводятся итоги многолетнего изучения аборигенной флоры заказника «Кокманский». Большая часть его территории покрыта лесными сообществами, преимущественно сосновыми, поэтому флора не богата и насчитывает 408 аборигенных видов сосудистых растений, относящихся к 220 родам и 74 семействам. На территории Кокманского заказника был обнаружен 41 редкий вид сосудистых растений, часть из которых включена в региональную Красную книгу (18 видов) и один вид - Dactylorhiza traunsteineri (Saut.) Soó - занесен в Красную книгу РФ. Кроме того, нами к редким отнесены виды, включенные в Приложение к региональной Красной книге (14 видов) и редко встречающиеся на территории республики.

Бесплатно

Флора охраняемого ландшафта «Сарашевские дубравы» (Пермский край)

Флора охраняемого ландшафта «Сарашевские дубравы» (Пермский край)

Ефимик Е.Г., Овеснов С.А.

Статья научная

Объект изучения - флора ООПТ регионального значения «Сарашевские дубравы» (Бардымский район Пермского края). Сарашевские дубравы - охраняемый природный ландшафт, расположенный в полосе широколиственно-хвойных лесов таежной зоны. На основании анализа литературных источников, гербарных коллекций и собственных материалов составлен список видов сосудистых растений, произрастающих на данной ООПТ. Во флоре ООПТ выявлено 449 видов сосудистых растений, относящихся к 257 родам и 79 семействам. На долю покрытосеменных приходится 96.4% общего количества видов, голосеменных - 0.9%, папоротниковидные составляют 1.6%, хвощевидные - 0.9% и плауновидные - 0.2%. Среди покрытосеменных растений преобладают двудольные. Десять наиболее крупных по числу видов семейств включают 229 видов, что составляет 51% всех видов флоры. Наиболее многочисленны во флоре одно- и двувидовые семейства. Таких семейств насчитывается 44. Флора ООПТ «Сарашевские дубравы» достаточно богата, разнообразна и может быть охарактеризована как широколиственно-лесная. Здесь отмечено 12 видов, нуждающихся в особом внимании к их состоянию в природной среде и 6 видов, подлежащих особой охране и мониторингу как включенные в Красные книги РФ (Cypripedium calceolus, Cephalanthera rubra) и Пермского края (Sanicula uralensis, Geranium sanguineum, Adenophora lilifolia, Neottia nidus-avis). Все это свидетельствует о целесообразности сохранения данной территории в качестве ООПТ.

Бесплатно

Флора скальных обнажений рек Березовая и Колва (в пределах Чердынского района Пермского края)

Флора скальных обнажений рек Березовая и Колва (в пределах Чердынского района Пермского края)

Ефимик Е.Г.

Статья научная

Изучена флора 16 скальных обнажений р. Березовая и Колва в пределах Чердынского района Пермского края. На исследуемой территории обнаружено 87 видов облигатньгх и факультативных петрофитов, относящихся к 64 родам и 31 семейству. На скалах обнаружено 2 вида, занесенных в Красную книгу РФ, 3 вида, занесенных в Красную книгу Пермского края и 17 видов из Приложения к Красной книге Пермского края. 19 местонахождений редких видов являются новыми для Пермского края и приводятся впервые.

Бесплатно

Флора сосудистых растений порта Ямбург

Флора сосудистых растений порта Ямбург

Ильминских Николай Геннадьевич, Красноперова Светлана Анатольевна

Статья научная

Приводятся данные о флоре порта г. Ямбурга (67° 54' с. ш., 74° 48' в. д.), расположенного на Тазовском п-ове в 148.5 км к северу от Полярного круга, в Ямало-Ненецком авт. округе Тюменской обл. Площадь порта около 4 га. Вся территория засыпана песком. Сплошного растительного покрова нет, он очень изреженный. Найдено 42 вида сосудистых растений (28.07.2013 г.). За 3 года экспедиционных работ в Арктике (2012-2014 гг.) только в порту г. Ямбурга были собраны Poa lanata Scribn. et Merrt, Lathyrus quinquenervis (Miq.) Litv. ex Kom. и Lathyrus pilosus Cham. x L. quinquenervis (Miq.) Litv. ex Kom. Установлено, что данные виды являются результатом рецентных миграций. Они редкие, поэтому в других местах не были отмечены. Выявлено, что все остальные виды заносятся с прилегающих природных территорий и находятся на разных стадиях апофитизационного процесса. В ходе проведенных исследований отмечено, что преобладают представители семейства Poaceae (17 видов), на втором месте - Fabaceae (5 видов), далее - Asteraceae и Polygonaceae (по 4 вида). Самыми массовыми видами оказались Artemisia tilesii, Crepis multicaulis, Tripleurospermum hookeri. Заносных видов всего 3: Poa angustifolia, Puccinellia distans, Puccinellia hauptiana. Малое число видов объясняется северным местоположением, толстым слоем песка и слабой ролью речного транспорта как источника заноса.

Бесплатно

Флористические находки в Республике Башкортостан

Флористические находки в Республике Башкортостан

Барлыбаева Миляуша Шарифулловна, Ишбирдин Айрат Римович, Суюндуков Ильгиз Варисович, Ишмуратова Майя Мунировна, Ильина Ирина Валерьевна, Кривошеев Михаил Михайлович, Мухаметшина Лейла Венировна, Набиуллин Марс Ишдавлетович, Барышникова Надежда Ивановна, Несговорова Олеся Викторовна

Статья научная

Приведены сведения о новых местонахождениях в Республике Башкортостан 15 видов сосудистых растений, среди них 1 естественный гибрид - Epipactis  schmalhausenii указывается для этой территории впервые; 1 синантропный вид для флоры ЮУГПЗ приводится тоже впервые. Гербарные образцы хранятся в гербарии Южно-Сибирского ботанического сада ФГБОУ ВО «Алтайский государственный университет» (ALTB, г. Барнаул).

Бесплатно

Формирование биопленок Escherichia coli при модификации редокс-статуса клеток

Формирование биопленок Escherichia coli при модификации редокс-статуса клеток

Лепехина Е.В., Смирнова Г.В., Октябрьский О.Н.

Статья научная

Исследована способность к биопленкообразованию у бактерий Escherichia coli, имеющих мутации по компонентам редокс-систем глутатиона и тиоредоксина и по регулятору общего стрессового ответа RpoS при разных ростовых температурах. Выявленная статистически значимая корреляция между удельным биопленкообразованием бактерий и экспрессией антиоксидантного гена katG при 37°С указывает на возможный вклад активации OxyR регулона при формировании биопленок бактериями. Мониторинг экспрессии гена sodA в исследуемых мутантах при 37°С показал 1.15-1.8-кратное ее повышение у gshA, gor, trxA, gshAtrxA и gortrxB мутантов. Установлена прямая зависимость между биопленкообразованием и экспрессией гена sodA в этих же условиях. Наличие мутаций по компонентам тиоловых редокс-систем значительно изменяло профиль зависимости продукции биопленок от температуры, что, вероятно, связано с нарушениями в редокс-регуляции путей передачи внутриклеточных сигналов. Показаны участие RpoS в процессе биопленкообразования при оптимальной ростовой температуре и RpoS-зависимый характер индукции биопленкообразования при 24°С и 44°С.

Бесплатно

Формирование биопленок уропатогенными штаммами Escherichia coli на различных абиотических поверхностях

Формирование биопленок уропатогенными штаммами Escherichia coli на различных абиотических поверхностях

Гизатуллина Ю.С., Кузнецова М.В.

Статья научная

Изучено формирование биопленок клиническими уропатогенными штаммами Escherichia coli (UPEC) на полистироле и абиотических поверхностях медицинского назначения - латексе, поливинилхлориде (ПВХ), силиконе. Биопленки были массивнее на полистироле, чем на катетерах из ПВХ (W-test: р=0.028) и силикона (р=0.027), но не латекса (р>0.05). Сформированные на поверхности урологических катетеров биопленки UPEC были массивнее на латексе (латекс vs ПВХ p=0.028; латекс vs силикон р=0.019). С увеличением гидрофильности атакованной поверхности, проанализированной по адсорбции нафталина, снижалась эффективность ее колонизации бактериями (латекс > полистирол > ПВХ > силикон). Выявленная сильная положительная связь между биомассой биопленки и гидрофобностью клеточной стенки на гидрофобных носителях (латекс: rs=0.675; полистирол: rs=0.713) уменьшалась на более гидрофильных поверхностях (ПВХ: rs=0.334; силикон: rs=0.371). Число бактерий UPEC в составе биопленки было различно на всех поверхностях, максимальное количество жизнеспособных клеток обнаружено на полистироле и силиконе. Показано, что самые массивные биопленки были сформированы на полистироле при концентрации глюкозы 3.5% и при pH 6.0 и 7.0.

Бесплатно

Формирование и развитие универсальных учебных действий при обучении биологии

Формирование и развитие универсальных учебных действий при обучении биологии

Акулов Александр Алексеевич

Статья научная

Приведены примеры заданий для формирования и развития универсальных учебных действий обучающихся, которые можно применять на разных этапах обучения (актуализации, усвоения учебного материала, контроля и оценки результатов). Предлагаемые задания построены на различных источниках информации (тексты, иллюстрации, таблицы, графики, диаграммы). Работа с ними рассчитана на интерпретацию, оценку, нахождение необходимых сведений, заданных в явном или неявном виде. Материалы могут быть использованы преподавателями биологии общеобразовательных учреждений для совершенствования профессиональной компетентности, достижения современного качества образования.

Бесплатно

Функциональное состояние вегетативной нервной системы у работающих в режиме труда с ночными сменами

Функциональное состояние вегетативной нервной системы у работающих в режиме труда с ночными сменами

Власова Елена Михайловна, Устинова О.Ю., Ивашова Ю.А., Носов Александр Евгеньевич

Статья научная

Проведено обследование 22 мужчин, работающих по графику с ночными сменами; средний возраст - 35.3±4.1 г., средний стаж работы - 10.2±3.1 г. и 28 мужчин, работающих без ночных смен; средний возраст - 37.9±3.3 л. (р>0.05), средний стаж работы - 13.2±3.2 л. (р>0.05). В программу обследования входили клиническая оценка состояния вегетативной нервной системы по опроснику А.М. Вейн и оценка вариабельности сердечного ритма, включающие определение функциональных показателей спектрального анализа в клиностазе, а именно: значение мощности спектра высокочастотного компонента (HF, %) и отношение значений низкочастотного и высокочастотного компонентов (LF/HF). Установлено, что у работников, осуществляющих трудовую деятельность по графику с ночными сменами, имеет место снижение активности вегетативной регуляции и низкий резерв механизмов адаптационной защиты.

Бесплатно

Характер системного воспаления у ВИЧ/ВГС коинфицированных больных с дискордантным ответом на антиретровирусную терапию

Характер системного воспаления у ВИЧ/ВГС коинфицированных больных с дискордантным ответом на антиретровирусную терапию

Сайдакова Е.В., Королевская Л.Б., Власова В.В.

Статья научная

Цель работы - характеристика системного воспаления у ВИЧ/ВГС коинфицированных пациентов с дискордантным ответом на лечение. Были обследованы: 1) ВИЧ/ВГС коинфицированные лица с дискордантным ответом на терапию (CD4+ Т-клетки менее 350/мкл); 2) ВИЧ/ВГС коинфицированные пациенты со стандартным ответом на терапию (CD4+ Т-лимфоциты более 350/мкл); 3) добровольные доноры крови без ВИЧ и ВГС инфекций. Показатели системного воспаления оценивали по содержанию в плазме крови провоспалительных и противовоспалительных цитокинов (эотаксин, IL-1β, IL-4, IL-5, IL-10, IL-13, MCP-1, MIP-1α, MIP-1β, IP-10, TNFα, TGF-β1, TGF-β2), уровни которых устанавливали методами мультиплексного и иммуноферментного анализов. В результате было установлено, что у ВИЧ/ВГС коинфицированных больных терапевтически неконтролируемое течение гепатита С приводит к развитию выраженного системного воспаления, которое лишь незначительно усугубляется при наличии дискордантного ответа на высокоактивную антиретровирусную терапию.

Бесплатно

Характеристика бактерий, выделенных из рудника Верхнекамского месторождения солей (Пермский край)

Характеристика бактерий, выделенных из рудника Верхнекамского месторождения солей (Пермский край)

Пьянкова А.А., Усанина Д.И., Алеев В.С., Блинов С.М., Плотникова Е.Г.

Статья научная

Из глинистых отложений рассолоотводящих выработок и рассолосборников рудника Верхнекамского месторождения солей (Пермский край) было выделено 29 штаммов галофильных/галотолерантных бактерий. В результате филогенетического анализа, проведенного на основе сравнения последовательностей гена 16S рРНК, было установлено, что выделенные культуры являются представителями классов Gammaproteobacteria (семейств Halomonadaceae и Salinisphaeraceae) и Bacilli (семейства Bacillaceae). Три галофильных штамма SHV2, RV14 и SWV1 имели сходство с ближайшим типовым штаммом вида Salinisphaera hydrothermalis на уровне 95.94-96.62% (ген 16S рРНК), что указывает на принадлежность этих штаммов к новому таксону. Большинство выделенных бактерий семейств Halomonadaceae и Bacillaceae являются экстремофилами: растут при рН 9-10 и высокой солености среды (до 250-270 г/л NaCl). У двух галофильных штаммов рода Halomonas обнаружена способность к деструкции салициловой и бензойной кислот (продуктов разложения полиароматических соединений), что делает их перспективными для использования в биотехнологиях восстановления загрязненных территорий с высоким уровнем минерализации.

Бесплатно

Журнал