Статьи журнала - Вестник Пермского университета. Серия: Биология
Все статьи: 857
Статья научная
Проведена трансформация акрилонитрила клетками нитрилутилизирующих бактерий Rhodococcus ruber gt1 и Pseudomonas fluorescens C2, иммобилизованными включением в структуру агарозного геля. Показано, что активность нитрилгидратазы иммобилизованных клеток не снижается, тогда как активность нитрилазы не превышает 20% от исходной. В то же время операционная стабильность нитрилазы иммобилизованных клеток P. fluorescens C2 выше, чем у нитрилгидратазы клеток штамма R. ruber gt1.
Бесплатно
Статья научная
Обнаружено, что большинство почвенных и клинических культур были пленкообразующими. Как гидрофильные по BATH-тесту штаммы (из водной фазы в фазу гексадекана экстрагировалось не более 5-8% клеток), так и более гидрофобные псевдомонады (экстрагировалось до 24,2%) проявляли высокую пленкообразующую способность, т.е. не было обнаружено четкого взаимного соответствия между гидрофильно-гидрофобными свойствами клеточной стенки бактерий и степенью пленкообразования. У клинических штаммов гетерогенность популяции по обоим признакам более выражена.
Бесплатно
Статья научная
Рассеянный склероз (РС) - это аутоиммунное нейродегенеративное заболевание, при котором иммунная система атакует собственный белок миелиновой оболочки нервных аксонов. В последнее время возрастает интерес к изучению роли в патогенезе данного заболевания недавно выделенной популяции клеток врожденного иммунитета - врожденных лимфоидных клеток (ILC). При этом установлено, что при беременности наблюдается ослабление проявлений Th1-опосредованных аутоиммунных патологий, в том числе РС. В данной работе исследовали фенотипические характеристики ILC клеток больных РС в сравнении со здоровыми донорами через 48 ч. после инкубации с гормоном беременности эстриолом (Е3) и клетками комменсальной микрофлоры. Для активации ILC использовались штаммы Ecsherichia coli K12 и Lactobacillus plantarum 8R-A3. Фенотип ILC оценивали методом проточной цитометрии с использованием окрашивания моноклональными антителами. Установлено, что Е3 и бактериальные факторы способны по-разному регулировать созревание подтипов ILC. В частности, клетки больных РС более подвержены гормональной модуляции, а здоровых доноров - бактериальной. В целом, исследуемые факторы оказывают влияние на фенотипические изменения ILC клеток, приводя к переходу из одного типа в другой, как у здоровых доноров, так и при РС.
Бесплатно
Гормональная регуляция тимической дифференцировки клеток при беременности (обзор)
Статья научная
Тимус является центральным органом иммунитета, где происходит формирование основных эф-фекторных и регуляторных субпопуляций Т-лимфоцитов. Беременность сопровождается стероид-индуцированной инволюцией тимуса. Подобная гормон-зависимая инволюция тимуса наблюдается также при стрессе, старении, ряде аутоиммунных заболеваний. При беременности плацента продуцирует массу биологически активных веществ, включая гормоны (эстриол, хорионический гонадо-тропин, кисспептин, лептин, грелин и др.), обладающие иммуномодулирующей активностью. Однако механизмы гормональной регуляции тимической дифференцировки лимфоцитов в аспекте беременности остаются малоисследованными. В обзоре проанализированы данные литературы и результаты собственных исследований, касающиеся роли гормонов, продуцируемых плацентой при беременности, в регуляции тимической дифференцировки и функций основных субпопуляций лимфоцитов, дендритных клеток и формировании иммунной толерантности.
Бесплатно
Грамотрицательные галофильные бактерии - деструкторы ортофталевой кислоты
Статья научная
Из рабочей коллекции микроорганизмов лаборатории молекулярной микробиологии и биотехнологии Института экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН было отобрано 5 штаммов грамотрицательных бактерий-деструкторов орто-фталата, выделенных из донных отложений водных объектов и поверхности шламохранилища, в районе добычи калийных солей (г. Березники, Пермский край). На основании филогенетического анализа (гены 16S рРНК), штаммы были отнесены к родам Pseudomonas, Idiomarina, Alcanivorax, Martelella, Breoghania. Установлено, что они являются галотолерантными микроорганизмами и способны к росту на полноценной среде в присутствии до 100 г/л NaCl, а также к росту на орто-фталевой кислоте в качестве субстрата при содержании до 70 г/л соли в среде культивирования. При выращивании в среде с повышенным засолением (30 г/л NaCl) у большинства штаммов наблюдались более высокие значения ростовых характеристик (максимальное значение ОП600, удельная скорость роста), чем в среде без добавления соли. У штамма Idiomarina sp. PSH17-1 выявлены повышенные параметры оптической плотности и удельной скорости роста в среде с 50 и 70 г/л соли. Полученные результаты исследования могут служить основой разработки эффективных биотехнологий для детоксикации и мониторинга фталатов в загрязненных/засоленных почвах.
Бесплатно
Грибы рода Inocybe (Fr.) Fr, Пермского края
Статья научная
Проведена инвентаризация грибов рода Inocybe (Fr.) Fr. Пермского края. Изучены анатомоморфологические особенности строения базидиом и распространение по лесным экосистемам. Выявлено 42 вида и внутривидовых таксона рода волоконница, в том числе два вида - новых для Пермского края - /. langei, I. petiginosa. Наибольшее количество видов Inocybe встречается в лиственных лесах.
Бесплатно
ДНК-протекторное действие полиаминов как фактор резистентности Escherichia coli к левофлоксацину
Статья научная
Изучено влияние биогенных полиаминов (путресцин, спермидин, кадаверин) на чувствительность Escherichia coli к действию левофлоксацина, антибиотика фторхинолонового ряда. Объект исследования: клинические штаммы E. coli с различной степенью устойчивости к фторхинолонам (чувствительные, переходные и устойчивые). Методы: антибиотикочувствительность оценивали по значению минимальной подавляющей концентрации (МПК), которую определяли модифицированным методом двукратных серийных разведений; о способности антибиотиков и полиаминов влиять на целостность бактериальной ДНК судили по изменению степени фрагментации плазмиды, которую наблюдали после разгонки в агарозном геле; детектирование гидроксильного радикала проводили флуоресцентным методом с использованием 3'-(гидроксифенил)флуоресцеина. Показано, что добавка в среду путресцина и, в большей степени, спермидина способствовала концентрационно-зависимому возрастанию устойчивости бактериальных клеток к левофлоксацину во всех трёх группах микроорганизмов, в то же время кадаверин не оказывал выраженного действия. Анализ ДНК клеток показал, что действие левофлоксацина сопровождается ее повреждением, степень которого зависела от концентрации антибиотика. Присутствие полиаминов препятствовало повреждению ДНК, при этом защитный эффект спермидина был сильнее, чем путресцина. Добавка левофлоксацина приводила к значительному увеличению количества активных форм кислорода (АФК) в клетках, в частности, гидроксильного радикала, а сила эффекта напрямую зависела от концентрации антибиотика. Добавка путресцина и спермидина эффективно снижала продукцию АФК, вызванную воздействием антибиотика. Таким образом, установлено, что в основе защитного эффекта путресцина и спермидина при действии фторхинолоновых антибиотиков лежит ДНК-протекторное действие, обусловленное, в частности, антиоксидантными функциями полиаминов.
Бесплатно
Два новых для России вида пауков (Araneae)
Статья научная
Впервые для фауны России указываются 2 вида пауков: Zelotes tenuis (L. Koch, 1866) из Краснодарского края и Xysticus laetus Thorell, 1875 из Ставропольского края.
Бесплатно
Дезинвазионное действие гипохлорита-натрия в профилактике метэхиноринхоза лососевых
Статья научная
Впервые в ихтиопаразитологической практике предлагается новый дезинфицирующий местный раствор гипохлорита-натрия, выпускаемый Сумгаитским химическим заводом, в профилактике метэхиноринхоза лососевых рыб. Механизм действия препарата зависит от содержания активного хлора. В данном случае яйца паразита погибают в 1%-ном растворе в течение 40 мин.
Бесплатно
Статья научная
Определены общая численность, плотность, возрастная структура ценопопуляций 5 видов из семейства Orchidaceae Juss. Установлено, что большинство ценопопуляций характеризуются правосторонним возрастным спектром (полночленным или неполночленным), генеративно-ориентированным. Для одной ценопопуляции D. fuchsii был выявлен левосторонний возрастной спектр с преобладанием имматурных особей.
Бесплатно
Статья научная
Рассматриваются некоторые вопросы популяционной биологии бокоплавов Crangonyx chlebnikovi Borutzky, 1928, обитающих в озерах Большой Мечкинской, Кунгурской ледяной и Бабиногорской пещер.
Бесплатно
Дендрофлора ООПТ «Черняевский лес» (г. Пермь)
Статья научная
Излагаются результаты изучения древесно-кустарниковьгх растений особо охраняемой природной территории местного значения «Черняевский лес» (г. Пермь). Приведен конспект, включающий 88 видов, из которых 36.8% - интродуценты, относящихся к 47 родам и 24 семействам.
Бесплатно
Деревья и кустарники скверов Дзержинского и Мотовилихинского районов г. Перми
Статья научная
Проведенное в 2014-2015 гг. обследование видового состава скверов, садов и бульваров (всего 30 объектов) Дзержинского и Мотовилихинского районов г. Перми показало, что видовое разнообразие древесно-кустарниковых растений у половины из них невелико - менее 20 видов. У 15 объектов число видов превысило 20. В результате обследования скверов Дзержинского района было найдено 93 вида и гибридогенных таксона из 25 родов и 18 семейств, в Мотовилихинском районе -101 вид и гибридогенный таксон из 22 родов и 17 семейств, а в обоих районах - 121 вид, 50 родов, 18 семейств. Более половины всех видов (54%) относятся к 2 семействам (Rosaceae - 35% и Salicaceae - 19%). Довольно многочисленными являются семейства Pinaceae (9 видов) и Oleaceae (7 видов). Деревьев из общего числа видов - 60, кустарников и полукустарников - 46, растений с непостоянной биоморфой - 15. Нами было обнаружено 8 таксонов, не отмечавшихся ранее для дендрофлоры Перми (Rosa davurica Pall., Rosa microdenia Mironova, Rosa tschatyrdagi Chshan., Populus moscowiensis R.I. Schroed., Salix reichardtii A.Kern., Salix stipularis Sm., Tilia x vulgaris Hayne, Tilia europaea L.). Проведенные исследования скверов Ленинского, Дзержинского, Мотови-лихинского районов выявили наличие в них 135 видов и гибридогенных таксонов из 51 рода и 18 семейств.
Бесплатно
Деревья и кустарники скверов Ленинского района города Перми
Статья научная
Видовое разнообразие древесно-кустарниковых растений большинства скверов, садов и бульваров (22 объекта) в наиболее старой части г. Перми, как показало проведенное в 2013-2014 гг. обследование, оказалось невелико - менее 20 видов. Лишь у 6 объектов число видов превысило 20. В скверах Ленинского района было найдено 89 видов деревьев и кустарников, относящихся к 42 родам и 19 семействам. Наиболее широко представлены роды Populus (8 видов), Rosa и Salix (по 6 видов), Malus (5 видов). 8 родов содержат по 3-4 вида, 9 родов - по 2 вида и 21 род - по 1 виду. Четыре наиболее крупных по числу видов семейства (Rosaceae, Salicaceae, Pinaceac, Oleaceae) включают 2/3 всех видов. 46 видов относятся к адвентивной фракции, 5 видов известны только из культуры, 42 вида - предоставляют аборигенную фракцию. Среди интродуцентов 16 видов азиатского происхождения, 5 - европейского, 3 - запад-нопалеарктического, 16 - североамериканского и 6 видов - евразиатского происхождения.
Бесплатно
Деревья и кустарники скверов Свердловского и Индустриального районов г. Перми
Статья научная
В 2016 г. проведено обследование видового состава древесных растений скверов, садов и бульва-ров (всего 25 объектов) Свердловского и Индустриального районов г. Перми. В результате обсле-дования скверов Свердловского района было найдено 112 видов и гибридогенных таксонов из 43 родов и 19 семейств, в Индустриальном районе - 84 вида и гибридогенного таксона из 39 родов и 17 семейств, а в обоих районах - 127 видов, 47 родов, 21 семейство. Более половины всех видов (58%) относятся к 2 семействам (Rosaceae - 35% и Salicaceae - 23%). Довольно многочисленными являются семейства Pinaceae (8 видов) и Oleaceae (7 видов). Большинство древесно-кустарниковых растений (84 вида, 66% общего числа) являются интродуцентами североамерикан-ского (18 видов), восточноазиатского (15), европейского (8) происхождения; 10 видов и гибридо-генных таксонов известны только из культуры. Обнаружено 9 таксонов, не отмечавшихся ранее для дендрофлоры г. Перми.
Бесплатно
Деструктор бифенила Rhodococcus sp. VR43-1: выделение, молекулярно-биологическая характеристика
Статья научная
В микробном сообществе донных отложений р. Чапаевки, протекающей по территории предприятия «Средне-Волжский завод химикатов» (г. Чапаевск, Самарская обл.), выявлены генетические структуры (bphA1-гены), кодирующие бифенил 2,3-диоксигеназу (БДО), ключевой фермент, ответственный за деструкцию бифенила и полихлорированных бифенилов (ПХБ, токсичные трудноразлагаемые поллютанты). Обнаружено сходство на уровне 95.8-99.7% исследуемых нуклеотидных последовательностей с генами α-субъединиц БДО и других диоксигеназ (подсемейства бензол/толуол ДО) штаммов рода Rhodococcus. С использованием метода накопительного культивирования из образца донных отложений был выделен активный штамм-деструктор бифенила, обозначенный VR43-1. При сравнению нуклеотидных последовательностей генов 16S рРНК с гомологичными последовательностями из базы данных EzBioCloud, штамм VR43-1 имел наибольший уровень сходства (100%) с типовым штаммом R. wratislaviensis NBRC 100605T. Сравнение гена bphA1 штамма VR43-1 с bphA1-генами активных деструкторов бифенила/ПХБ R. jostii RHA1 и штаммов R. wratislaviensis Р13 и Ch628 показало их сходство на уровне 99.1 и 100%, соответственно.
Бесплатно
Статья научная
Оценена способность к деструкции бенз(а)пирена (БП) в почве Rhodococcus wratislaviensis KT112-7, выделеного из техногенно-минеральных образований предприятия БКРУ1 ПАО «Уралкалий» (г. Березники, Пермский край). Для эксперимента была использована дерново-подзолистая почва, отобранная с территории биостанции (д. Ключи Добрянского р-на, Пермский край) и технозем с окраины г. Соликамска (Пермский край). Внесение бактерий в почву приводило к снижению концентрации в ней БП. В дерново-подзолистой почве концентрация БП снизилась в течение месяца на 26.1, в техноземе - на 45.4%. Добавление бензойной кислоты в дерново-подзолистую почву в дозе 100 мг/кг усиливало положительный эффект внесения бактерий. Полученные данные указывают на деструкцию БП в почве штаммом R. wratislaviensis KT112-7 в присутствии органических веществ, которые штамм использует в качестве субстрата. Полученные данные и штамм R. wratislaviensis KT112-7 могут быть применены при разработке новых биотехнологий очистки окружающей среды от БП.
Бесплатно
Статья научная
В результате проведенных исследований установлено, что бактерии разных штаммов коагулазоне-гативных стафилококков обладают выраженной способностью к образованию биопленок. Динамика роста биопленок бактерий разных штаммов существенно различается. Биопленки, образованные антибиотикочувствительными бактериями, достигают своего максимума через сутки. Пленкофор-мирующий процесс бактерий полирезистентного штамма развивается более медленно, характеризуется перманентным ростом и достигает максимума лишь на 4 сутки. Предупреждение развития биопленок стафилококков возможно при внесении в среду роста низкомолекулярных антибактериальных катионных пептидов - варнерина и хоминина. Как показали эксперименты, данные пептиды способны не только предупреждать развитие биопленок, но и активно разрушать уже сформированные зрелые биопленки коагулазонегативных стафилококков.
Бесплатно
Статья научная
Фталевая и терефталевая кислоты (ОФК и ТФК) имеют широкое применение в химической промышленности в качестве пластификаторов для получения полимерных материалов, в связи с чем являются распространенными экополлютантами. Изучена способность штамма Paenarthrobacter sp. SA101, выделенного из образца сточных вод химического предприятия (г. Пермь), к росту в присутствии ОФК и ТФК в высоких концентрациях. Показано, что штамм SA101 способен расти на данных субстратах в концентрациях до 20 г/л, что для представителей рода Paenarthrobacter показано впервые. В средах с ОФК зафиксированы более высокие параметры роста штамма, чем в средах с ТФК: максимальное значение ОП600 (1.64), наиболее высокая удельная скорость роста (0.073±0.003 ч-1) и наименьшая продолжительность лаг-фазы наблюдались в среде с 10 г/л ОФК. При использовании 20 г/л ТФК зафиксирована более высокая удельная скорость роста (0.04±0.002 ч-1) и максимальное значение ОП600 (1.6), однако подготовительная фаза роста была более продолжительной, чем в среде с 10 г/л ТФК. Штамм SA101 способен к утилизации 76% ОФК за 39 ч. и 74.2% ТФК за 71 ч. культивирования при использовании данных субстратов в концентрации 10 г/л. Клетки штамма SA101 содержат плазмиду молекулярной массой ~100 т.п.н. Штамм SA101 является перспективным для разработки биотехнологических методов очистки загрязненных фталатами почв и промышленных стоков.
Бесплатно
Статья научная
Разработаны две системы праймеров, подобраны условия полимеразной цепной реакции и состав ПЦР-смеси для амплификации фрагмента ect-оперона, включающего гены ectB и ectG, детерминирующие Ь-2,4-диаминобутиратаминотрансферазу и эктоинсинтезу, соответственно, на матрице ДНК бактерий родов Rhodococcus, Microbacterium и Brevibacterium. Проведен скрининг 9 штаммов бактерий, выделенных из почвы района промышленной разработки Верхнекамского соленосного бассейна, с применением разработанных систем праймеров. В ходе амплификации специфический продукт генов-мишеней получен на матрице ДНК штаммов Brevibacterium sp. B-R и Microbacterium sp. Y6, а также представителей филогенетических групп R. erythropolis и R. rhodochrous рода Rhodococcus. На матрице ДНК штамма Microbacterium sp. SMB33 специфический продукт не был синтезирован, что может указывать на отличие генетических детерминант синтеза эктоина этого штамма от известных.
Бесплатно
