Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio
Статьи журнала - Вестник Пермского университета. Серия: Биология
Все статьи: 925
Статья научная
Проведены молекулярно-генетический анализ и идентификация четырех популяций Pinus sylvestis L., расположенных в Республике Коми и в Кировской обл., с использованием ISSR-метода анализа полиморфизма ДНК. У четырех изученных популяций P. sylvestris выявлены 117 ISSR-маркеров; установлена высокая доля полиморфных локусов (Р95 =0.949). Один ISSR-праймер инициировал у P. sylvestris синтез в среднем 16.7 ISSR-маркеров. В изученных популяциях выявлено 16 редких ISSR-маркеров. Выявлены идентификационные мономорфные видовые и полиморфные ISSR-маркеры, а также их сочетания для молекулярно-генетической идентификации изученных популяций. Составлены молекулярно-генетические формулы и штрихкоды четырех изученных популяций. Полученные данные могут быть использованы для идентификации популяций и древесины P. sylvestris в изученных регионах.
Бесплатно
Статья научная
Проведено проспективное молекулярно-генетическое исследование клинических изолятов лактозонегативной Escherichia coli, выделенных у больных COVID-19 в острый период заболевания (1-ая группа обследованных). 2-ю и 3-ю группы составили пациенты с отдаленными последствиями COVID-19 – через 3 месяца и через 6 месяцев соответственно. Диагноз подтверждали методом ПЦР РНК SARS Cov-2 с обратной транскрипцией. Произведено определение полных нуклеотидных последовательностей участков генов патогенности, кодирующих синтез фимбриальных адгезинов (fimH), аэробактина (aer), белка IbeA (ibeA) и гемолизина (hlyF). Проведен биоинформационный анализ консервативных участков исследованных фрагментов геномов лактозонегативной E. coli. Установлено, что частота встречаемости олигонуклеотидных последовательностей генов, детерминирующих патогенность, в первой группе составила 95.2%, во второй – 95.2%, в третьей – 100% (в контрольной группе здоровых – 20.0% изолятов), что свидетельствует о повышении патогенного потенциала исследованных штаммов лактозонегативной E. coli во всех группах. В первой группе ген fimH обнаружен у 81.0%, ген aer – у 33.3%, ген ibeA – у 23.8%, ген hlyF – у 19.0% штаммов. Во второй группе ген fimH выявлен у 88.3%, ген ibeA – у 26.2%, ген aer – у 31.0%, ген hlyF – у 9.5% штаммов. В третьей группе ген fimH обнаружен у 100.0% штаммов, ген aer – у 64.0%, ген ibeA – у 56.0%, ген hlyF – у 40.0%. В контроле ген fimH и ген aer были выявлены у 10.0% и 10.0% штаммов соответственно. Следовательно, наиболее встречаемым геном явился fimH. Частота его встречаемости в первой группе в 8.1, во второй – в 8.8 и в третьей – в 10.0 раз была выше контрольных значений, гена aer – в 3.3, 3.0 и 6.4 раза соответственно.
Бесплатно
Статья научная
Наиболее частым возбудителем нозокомиальных инфекций являются ацинетобактеры, принадлежащие к виду Acinetobacter baumannii. Уровень смертности при внутрибольничных пневмониях достигает 35%. Важную роль в патогенности играют факторы, активно действующие на всех этапах инфекционного процесса, определяющие повреждение тканей макроорганизма и выживание микроорганизма. Несмотря на то, что A. baumannii обладает большей патогенностью для человека в отличие от других представителей рода, из образцов мокроты больных внебольничной пневмонией (ВП) выделяются также представители других видов − A. calcoaceticus и A. junii. Целью настоящего исследования являлось выявление генов, кодирующих факторы патогенности штаммов ацинетобактеров, выделенных из образцов мокроты пациентов с ВП, находящихся в медицинских организациях (МО) г. РостованаДону, а также из смывов с объектов внешней среды отделений медицинских организаций. Видовую принадлежность изолированных штаммов подтверждали массспектрометрическим методом (MALDITOF). Полногеномное секвенирование штаммов Acinetobacter spp. проводили на платформе «Illumina MiSeq» c использованием набора «Nextera DNA Library Preparation Kit». Поиск генов факторов патогенности исследуемых штаммов проводили при помощи программы «Fragment Extractor». В качестве базы данных нуклеотидных последовательностей использовали базу данных NCBI. Среди выделенных штаммов Acinetobacter 91.8% составили представители вида A. baumannii, в единичных случаях были изолированы A. calcoaceticus и A. junii. Исследованные штаммы обладали широким набором генов факторов патогенности, которые родственны как у клинических штаммов, так и у штаммов, изолированных из смывов с объектов внешней среды медицинских организаций, что, повидимому, свидетельствует об их родстве.
Бесплатно
Молекулярно-генетический анализ генов ADRB2, NOS3 и PPARGC1A у единоборцев города Перми
Статья научная
Изучение генетической предрасположенности к определенным видам спортивной деятельности позволит научно обосновать проведение отбора наиболее перспективных спортсменов и корректировку их тренировочного процесса, т.к. эти данные влияют на формирование физических качеств спортсменов. Цель данного исследования - выявление взаимосвязи полиморфных вариантов генов ADRB2 (Adrenoceptor Beta 2), NOS3 (Nitric Oxide Synthase 3) и PPARGC1A (Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma Coactivator 1-Alpha), ассоциированных с выносливостью, у занимающихся дзюдо и вольной борьбой спортсменов с разной спортивной квалификацией. Выборка для исследований включала 50 человек, из которых 27 спортсменов, занимающихся дзюдо в спортивной школе «Витязь», и 23 спортсмена, занимающихся вольной борьбой в спортивно-оздоровительном клубе «Планета» г. Перми. В зависимости от спортивной успешности единоборцы были распределены в Группу I с высокой и в Группу II с низкой квалификацией. У единоборцев в возрасте от 10 до 16 лет проведены исследования с использованием полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ) и выявлены полиморфизмы трех полиморфных локусов: G/T гена NOS3 (rs1799983), G/A гена PPARGC1A (rs8192678) и A/G гена ADRB2 (rs1042713). Проведен анализ взаимосвязи между аллельными вариантами генов у единоборцев и их спортивной квалификацией; установлены достоверные отличия между Группой I и Группой II для генотипа A/A (Fоп 2.98 > 1.96 при p = 0.05) и генотипа G/G (Fоп 2.60 > 1.96 при p = 0.05) гена ADRB2, а также для генотипа G/A гена PPARGC1A (Fоп 2.43 > 1.96 при p = 0.05). Частота общего генетического балла (ОГБ), рассчитанного для физического качества «выносливость», на основании полиморфизма генов ADRB2, NOS3 и PPARGC1A у 50 единоборцев, варьировалась от 33 до 100. Единоборцы с наибольшим ОГБ имеют высокую квалификацию.
Бесплатно
Молекулярные основы современных подходов к анализу продуктивной функции тимуса
Статья научная
Рассмотрена информация о тимусе - центральном органе иммунной системы, обеспечивающем микроокружение, необходимое для созревания и селекции CD4+ и CD8+ Т-лимфоцитов. Дана справка об основных событиях в истории изучения вилочковой железы. Продемонстрирована высокая значимость органа в восстановлении иммунной системы при опустошении пула Т-лимфоцитов. Представлены данные о молекулярных механизмах формирования разнообразия антигенраспознающих рецепторов Т-клеток, которые легли в основу современных подходов к анализу продуктивной функции вилочковой железы. Приведены примеры использования методов определения функциональной активности тимуса в науке и клинической практике.
Бесплатно
Мониторинг миграционной активности растений между открытым и защищенным грунтом
Статья научная
В оранжерейных комплексах Главного ботанического сада им. Н.В. Цицина Российской академии наук, г. Москва (ГБС РАН) был организован с определенной периодичностью мониторинг миграционной активности спонтанно расселяющихся растений между открытым и защищенным грунтом. Актуальность этой работы заключается в идентификации видов, которые в силу своих адаптивных возможностей, агрессивного распространения и особенностей климата могут представлять потенциальную опасность как чужеродные таксоны. Всего вокруг всех оранжерей ГБС РАН (в пределах 15 м) было выявлено 174 вида из 123 родов растений открытого грунта, большинство из которых местные и адвентивные сорные растения. Только 32 вида из 28 родов растений открытого грунта были обнаружены на конструкциях оранжерей и ещё меньше попали в защищенный грунт - 24 вида из 22 родов. Только 4 вида растений защищенного грунта были обнаружены на наружных конструкциях оранжерей, причем 3 вида относятся к папоротникам. Единственное из них цветковое растение Cymbalaria muralis было многократно найдено как на наружных стенах и в щелях оранжерей, так и на расстоянии до 15 м от зданий оранжерей. В открытом грунте это растение образует популяции до нескольких десятков экземпляров, обильно цветет и завязывает плоды с жизнеспособными семенами, которые успешно перезимовывают в глубоких выемках стен или под пологом снега.
Бесплатно
Статья научная
В настоящее время на территории Пермского края выявлено 867 видов и внутривидовых таксонов агарикоидных базидиомицетов, из числа которых пять видов занесены в Красную книгу Пермского края, в том числе - поганка бледная (Amanita phalloides (Vaill.ex Fr.) Link), статус III. С 2006 г. ведется мониторинг состояния охраняемых видов грибов. В Пермском крае обнаружено 5 местообитаний поганки бледной. Состояние вида удовлетворительное.
Бесплатно
Мониторинг охраняемых грибов Пермского края: Lactarius volemus (Fr.) Fr. - подмолочник
Статья научная
В настоящее время на территории Пермского края 5 видов грибов занесены в региональную Красную книгу, в том числе подмолочник, молочай (Lactarius volemus (Fr.) Fr.), статус III. Этот микоризный гриб вступает в симбиоз с корнями широколиственных древесных пород. С 2006 г. ведется мониторинг состояния охраняемых видов грибов. В Пермском крае известно 5 мест обитания подмолочника: Бардымский р-н (окр. с. Барда); 2 - Бардымский р-н (ООПТ «Дубовая гора»); 3 - Пермский р-н (окр. с. Коммунар); 4 - Чайковский р-н (окр. с. Бурёнка); 5 - Кунгурский район (ООПТ «Предуралье»). Плановые наблюдения проводились в 2007, 2010, 2014 гг. Наибольшее число (6 плодовых тел) обнаружено в 2006 г. на ООПТ «Дубовая гора». Состояние Lactarius volemus на территории Пермского края следует считать удовле-творительным. Гриб охраняется на территориях ООПТ «Дубовая гора» и «Предуралье». Не-обходим поиск новых местонахождений вида в Пермском крае и проведение стационарных исследований.
Бесплатно
Мониторинг популяций Dactylorhiza fuchsii (Druce) Soo в Южно-Уральском заповеднике
Статья научная
Приводятся результаты мониторинга состояния четырех ценопопуляций Dactylorhiza fuchsii, проведенного в Южно-Уральском государственном природном заповеднике. Изучены популяци-онные (численность, плотность, возрастной спектр, индекс индивидуального оптимума, индекс восстановления, морфологическая изменчивость) и виталитетные характеристики. Установлено различие горно-луговых и лесных популяций по демографическим и морфологическим характеристикам. Установлено, что фитоценотический и погодный факторы влияют на габитус растений, численность особей, соотношение возрастных групп в популяциях. Возрастные спектры исследованных популяций полночленные, правосторонние, с преобладанием генеративных особей. Изученные ценопопуляции вида находятся в удовлетворительном состоянии. Дан сравнительный анализ состояния популяций D. fuchsii в других природных заповедниках Республики Башкортостан.
Бесплатно
Мониторинг редких и охраняемых видов животных южной лесостепи и степной зоны Омской области
Статья научная
Приведено описание распределения видов животных, занесенных в Красную книгу Омской области (2015) и встреченных в ходе полевых работ 2021-2022 гг. на территориях, включающих южно-лесостепную и степную части региона. Исследование проведено с помощью стационарных и маршрутных методов мониторинга видового богатства и численности животных. Описаны факты встреч 82 охраняемых видов животных, 35 из которых занесены в Красную книгу РФ. Указаны наиболее предпочитаемые местообитания и дана общая оценка численности исследованных объектов животного мира. Полученные сведения приводят к необходимости корректировки списка охраняемых видов и категорий их редкости в планируемом на 2025 г. третьем издании Красной книги Омской области. Необходимо включить в Красную книгу региона три вида: пчелу-плотника карликовую Xylocopa iris (Christ 1791), эрезус коллара Eresus kollari (Rossi 1846) и дубровника Ocyris aureoles (Pallas 1773). Еще четыре вида следует исключить из списка в связи со стабилизацией численности и отсутствием объективных угроз для популяций в Омской области: андрена аккуратная Andrena comta (Eversmann 1852), андрена угольная Andrena pilipes (Fabricius 1781), а также журавль серый Grus grus (Linnaeus 1758) и соловей Luscinia luscinia (Linnaeus 1758).
Бесплатно
Статья научная
Управление сельскохозяйственным производством, особенно в регионах с рискованным земледелием, должно быть основано на принципах постоянного контроля проведения агротехнических и агрохимических мероприятий, условий пофазового развития культур, уточнения урожайности и валовых сборов. Объективные данные о состоянии сельскохозяйственных культур на больших территориях можно получать на региональном уровне только с использованием данных дистанционного (спутникового) зондирования. Использование этих данных позволяет существенно снизить материальные затраты на проведение мониторинга сельскохозяйственных угодий на больших площадях. С учетом пространственного характера поставленных выше задач, наиболее подходящим инструментом для проведения исследований в этой области служат геоинформационные системы. Для получения сведений о состоянии и условиях произрастания сельскохозяйственных культур использовались данные спектрорадиометра MODIS, полученные со спутника Terra. В программе Image Processor по специальным алгоритмам производился расчет температуры земной поверхности и оценивалось состояние растительности. Далее средствами ArcGIS строились карты состояния растительности, температуры земной поверхности и индекса засухи.
Бесплатно
Статья научная
Подведены итоги многолетнего мониторинга биоты эктомикоризных грибов в некоторых типах еловых лесов Пермского края. Исследования проводились стационарным методом на учетных площадях размером 50 × 20 м, заложенных по одной в исследуемых типах леса - ельнике приручьевом и ельнике кисличном. Работа осуществлялась в три периода: I - 1975-1977 гг., II - 1994-1996 гг., III - 2010-2012 гг. В каждый год наблюдений по 4 раза с интервалом в 10 дней собирались все плодовые тела грибов, учитывалось их число и воздушно-сухая биомасса. К настоящему времени выявлено от 80 (ельник кисличный) до 124 (ельник приручьевой) видов и внутривидовых таксонов эктомикоризных грибов. Большинство выявленных видов относится к семействвам Cortinariaceae, Russulaceae и Tricholomataceae, что характерно для бореальной зоны. Наибольшее число выявленных видов (72.6-75.0%) обнаруживалось от 2 до 9 раз, а 2-3% из них были постоянными, встречались ежегодно. Отмечена относительная стабильность видового состава сосудистых растений (коэффициенты Жаккара (J×100): J = 69-88) во времени и зафиксированы более значительные изменения видового состава микоризообразователей (J = 32-52). Продуктивность эктомикоризных грибов в исследуемых ценозах различается по годам и периодам наблюдений. Наибольшее число базидиом зафиксировано для ельника кисличного, а их наибольшая биомасса - для ельника приручьевого. Для биоты микоризообразователей как по числу (индекс Шеннона: H = 1.27), так и по биомассе (H = 1.54) базидиом за все периоды наблюдений более благоприятным являлся ельник приручьевой. Установлено, что повышение средней месячной температуры воздуха в июне благоприятствует «плодоношению» микоризообразователей в августе в ельнике кисличном (rs = 0.67; p function show_abstract() { $('#abstract1').hide(); $('#abstract2').show(); $('#abstract_expand').hide(); }
Бесплатно
Мониторинг эктомикоризных грибов ельника кисличного в южнотаежных лесах Пермского края
Статья научная
В Пермском крае с 1975 г. по настоящее время проводится мониторинг агарикоидных базидиомицетов в ельнике кисличном подзоны южной тайги. Исследования ведутся стационарным методом на пробной площади, размером 50 × 20 м, в три периода: I-й - в 1975-1977 гг., II-й - в 1994-1996 гг., III-й - в 2010-2012 гг. К настоящему времени в ельнике кисличном обнаружено 214 видов и внутривидовых таксонов агарикоидных базидиомицетов, 80 из которых (37.4 %) являются микоризообразователями, входящими в состав 18 родов и 7 семейств. Преобладают виды сем. Cortinariaceae, Russulaceae и Boletaceae, что характерно для бореальной зоны. Наибольшее число видов содержится в родах Cortinarius (21 вид), Russula (15), Lactarius (10), Amanita (7), что свойственно лесным ценозам подзоны южной тайги. Отмечено, что видовой состав эктомикоризных грибов с течением времени меняется в большей степени (коэффициенты Жаккара (J×100): J = 32-46), чем видовой состав сосудистых растений. Эктомикоризные грибы доминируют по биомассе и числу базидиом. Изучена связь между разнообразием и продуктивностью эктомикоризных грибов с основными климатическими показателями (май-сентябрь). Установлено, что повышение средней месячной температуры воздуха в июне благоприятствует «плодоношению» эктомикоризных грибов в августе (rs = 0.67; p
Бесплатно
Мониторинг эктомикоризных грибов сосняка брусничного
Статья научная
В Пермском крае с 1975 г. по настоящее время проводится мониторинг агарикоидных базидиомицетов в разных типах леса (подзона южной тайги). Исследования велись стационарным методом (пробные площади 50x20 м) в 3 этапа: I - 1975-1977 гг., II - 1994-1996 гг., III - 2010-2012 гг. Регулярно, один раз в декаду в августе и начале сентября, учитывался видовой состав грибов, количество базидиом каждого вида и их сырая биомасса. В статье обсуждаются результаты исследований, проведенных с 1975 по 2012 гг. в сосняке брусничном. К настоящему времени в сосняке брусничном обнаружено 182 вида и внутривидовых таксона агарикоидных базидиомицетов, 101 из которых (55.5%) является эктомикоризными грибами, вступающими в симбиоз в основном с Pinus sylvestris L., отличающейся широким набором ми-коризообразователей. Грибы входят в состав 8 семейств и 19 родов. Преобладают представители сем. Cortinariaceae, Russulaceae, Tricholomataceae и Boletaceae. Наибольше количество видов микоризных грибов содержится в 5 родах: Cortinarius (41 вид), Russula (16), Lactarius (9), Amanita (6), Tricholoma (5). Отмечено, что на фоне некоторого изменения видового состава высших растений (индексы общности по Жаккару: J I-n =69; J II-III =61; J I-III =50) большей трансформации подверглась биота микоризных грибов. Индексы общности, вычисленные по появляющимся базидиомам, колебались от 43 до 46. Индексы общности, вычисленные с учетом выявленного мицелия, были довольно высокими и составляли 71-86. Количество доминантов грибов по биомассе в разные периоды варьировало от 7 до 10 видов, а по числу базидиом - от 5 до 7 видов. Ежегодно видовой состав доминантов значительно обновляется. Индекс общности по биомассе колеблется от 5 до 31; по количеству базидиом - от 5 до 7.
Бесплатно
Мониторинг эктомикоризных грибов сосняка чернично-сфагнового в южно-таежных лесах Пермского края
Статья научная
В Пермском крае с 1975 г. проводится мониторинг агарикоидных базидиомицетов в разных типах леса подзоны южной тайги. Исследования ведутся стационарным методом (пробные площади размером 50x20 м) в 3 этапа: I - 1975-1977 гг., II - 1994-1996 гг., Ш - 2010-2012 гг. Несмотря на высокую влажность в сосняке чернично-сфагновом, микориза у Pinus sylvestris L. и Betula pubescens Ehrh. хорошо развита, микоризные окончания сложного строения. К настоящему времени в сосняке чернично-сфагновом обнаружено 80 видов и внутривидовых таксонов агарикоидных базидиомицетов, 45 из которых (56.3 %) являются микоризообразователями, входящими в состав 7 семейств и 12 родов. Преобладают виды сем. Cortinariaceae и Russulaceae. Наибольшее число видов содержится в 4 родах: Cortinarius (21 вид), Lactarius (6), Hebeloma (4), Russula (3). Отмечено, что на фоне незначительных изменений видового состава сосудистых растений (коэффициенты Жаккара: JI-II = 83, JII-III = 82, JI-III = 75) и возрастания обводнения, произошла трансформация биоты микоризных грибов. Индексы общности, вычисленные по видовому составу грибов, колебались от 7 до 32. Микоризные грибы входят в состав доминантов по биомассе и числу базидиом. Изучена связь между разнообразием и продуктивностью микоризных грибов с основными климатическими факторами. Установлено отрицательное воздействие июньских осадков на плодоношение эктомикоризных грибов (rs = -0.70).
Бесплатно
Морфобиологическая характеристика хариуса р. Язьвы (пр. Вишеры; Thymallidae, Salmoniformes)
Статья научная
Представлены основные морфобиологические показатели хариуса р. Язьвы с притоками, показаны особенности и черты сходства с другими популяциями вида в регионе, особое внимание уделено изменчивости параметров в онтогенезе и межпопуляционном плане.
Бесплатно
Статья научная
Получены АСМ-изображения и вычислены морфометрические параметры клеток факультативного алкалофила Bacillus aequororis 5-ДБ и нейтрофильного B. subtilis ATCC 6633 после инкубации в щелочной среде с высокой концентрацией хлорида натрия. Показано, что адаптация B. aequororis 5-ДБ не сопровождается значительными изменениями морфометрических параметров, при этом незначительно (в 1–1.5 раза) снижается объем клеток и возрастает шероховатость их поверхности. Нейтрофильная бацилла, наоборот, реагирует на увеличение концентрации соли и рН (50 г/л, рН 11) значительными изменениями клетки: в 2–3 раза уменьшается объем клетки, а при суточной адаптации к 50 г/л соли и рН 8 возрастает в 2.4 раза за счет увеличения длины клетки. Морфология клеток алкалофильной бациллы, в отличие от таковой нейтрофильной, не претерпевает значительных изменений при высокой минерализации среды как при непосредственном воздействии, так и после суточной адаптации.
Бесплатно
Морфологические особенности семян трех видов коровяка (Verbascum L.)
Статья научная
Излагаются результаты изучения морфологического строения семян и микроструктуры спермодермы трех видов Verhascum L. Предложен комплекс признаков, позволяющих определить видовую принадлежность семян.
Бесплатно
Морфологические особенности чешуи ручьевого и речного экотипов европейского хариуса
Статья научная
Описаны особенности поверхностной скульптуры чешуи у разнотипных популяций хариуса бассейна р. Камы; приведены данные о структуре и частоте встречаемости «мальковых колец », «нерестовых марок», описана специфика формирования годовых колец, проанализированы наиболее типичные затруднения, возникающие при определении возраста у хариусов.
Бесплатно
Статья научная
Излагаются результаты сравнительного морфолого-анатомического изучения обоеполых и женских цветков Glechoma hederacea. Найдены отличия в размерах всех органов цветка, за исключением завязи. Сравнительно-анатомическое исследование строения венчика и чашечки позволило также выявить некоторые отличительные признаки: женские цветки имеют меньшие размеры клеток, характеризуются большим опушением простыми и железистыми волосками, большим количеством устьиц и эфирномасличных железок.
Бесплатно
