Статьи журнала - Вестник Пермского университета. Серия: Биология

Все статьи: 925

Методические подходы к зонированию территории крупного промышленного центра по показателям заболеваемости населения в связи с качеством среды обитания

Методические подходы к зонированию территории крупного промышленного центра по показателям заболеваемости населения в связи с качеством среды обитания

Зайцева Н.В., Май И.В., Клейн С.В., Кирьянов Д.А., Балашов С.Ю.

Статья научная

Проведена параметризация и оценка многофакторного техногенного воздействия на распространенность заболеваемости населения с помощью оценки и анализа корреляционных полей. По наличию и силе связи между параметром воздействия среды обитания и распространенностью персонифицированной заболеваемости на изучаемой территории проведено пространственное зонирование (дифференциация) заболеваемости населения крупного промышленного центра.

Бесплатно

Методы медико-демографического анализа на популяционном уровне

Методы медико-демографического анализа на популяционном уровне

Цинкер Михаил Юрьевич, Кирьянов Дмитрий Александрович

Статья научная

Данная статья ориентирована на аналитические исследования в области медико-демографического анализа. В качестве основных источников информации рассматривались территориальные органы государственной статистики. Предложен комплекс методов, позволяющих исследовать медико-демографическую ситуацию на популяционном уровне. Методы апробированы для Пермского края и Удмуртской республики

Бесплатно

Методы очистки загрязненных тяжелыми металлами почв с использованием (био)сурфактантов (обзор)

Методы очистки загрязненных тяжелыми металлами почв с использованием (био)сурфактантов (обзор)

Костина Л.В., Куюкина М.С., Ившина И.Б.

Статья научная

Рассмотрены варианты классификации тяжелых металлов по физико-химическим свойствам и степени опасности для окружающей среды, взаимодействие их с почвенными компонентами и современные технологии очистки почвы, загрязненной данными ксенобиотиками. Обоснована эффективность применения биосурфактантов для ремедиации почв, загрязненных тяжелыми металлами.

Бесплатно

Механизмы взаимодействия мелатонина с лимфоцитами

Механизмы взаимодействия мелатонина с лимфоцитами

Куклина Е.М., Глебездина Н.С.

Статья обзорная

Мелатонин представляет собой индоламин, синтезируемый из незаменимой аминокислоты триптофана. На системном уровне он производится преимущественно эпифизом, а на локальном - большинством органов и тканей. Гормон регулирует широкий спектр биологических реакций в норме и при патологии и обладает выраженной антиоксидантной, противовоспалительной и противоопухолевой активностью. Также он является эффективным регулятором иммунной системы, однако имеющиеся на сегодняшний день данные по проблеме крайне противоречивы, особенно это касается основных эффекторов адаптивного иммунитета - Т-лимфоцитов. С одной стороны, в физиологических условиях или при иммунодефицитных состояниях эффекты мелатонина, как правило, стимулирующие: он усиливает про-лиферативный ответ Т- и В-лимфоцитов, повышает продукцию Th1-цитокинов и ингибирует апоптоз лимфоцитов, индуцируемый различными стимулами. С другой стороны, имеется не меньшее количество работ, демонстрирующих иммуносупрессивную активность мелатонина, в частности, подавление продукции провоспалительных цитокинов. Разрешение этих противоречий и является целью настоящего обзора. При этом в работе сделаны акценты на два принципиальных момента. Во-первых, основная часть иммуностимулирующих эффектов получена в экспериментах in vitro, тогда как иммуносупрессивных - in vivo, а поскольку мелатонин контролирует синтез целого ряда других гормонов гипоталямо-гипофизарно-адренальной и/или гонадальной осей, многие из которых сами являются эффективными иммуномодуляторами, его непосредственные эффекты in vivo могут опосредоваться и нивелироваться другими гормонами. Во-вторых, лимфоциты экспрессируют три высокоаффинных рецептора для мелатонина - два мембранных, МТ1 и МТ2, и ядерный, RORα, а также целый ряд низкоспецифичных мишеней, и все с разной аффинностью к мелатонину. Связывание разных рецепторов запускает, по-видимому, различные сигнальные механизмы. Соответственно, физиологические, патологические и фармакологические концентрации мелатонина могут иметь разные иммуномодулирующие эффекты, и при оценке действия мелатонина на иммунную систему важно соотносить концентрации гормона с состоянием рецепторного аппарата исследуемых клеток.

Бесплатно

Механизмы регуляции лептином микробицидного потенциала моноцитов периферической крови женщин

Механизмы регуляции лептином микробицидного потенциала моноцитов периферической крови женщин

Орлова Е.Г., Ширшев С.В.

Статья научная

Исследовано влияние лептина в дозах, сопоставимых с концентрацией гормона при беременности, на микробицидную активность моноцитов в крови у женщин. Показано, что гормон разнонаправленно модулирует ферментативную активность эластазы, катепсина G и миелопероксидазы. Лептин не влияет на спонтанную люминол-зависимую хемилюминесценцию (ЛЗХЛ) и дозозависимо активирует стимулированную ЛЗХЛ. Молекулярный механизм реализации эффектов лептина в процессе регуляции биоцидного потенциала моноцитов связан с работой скавенджер-рецепторов.

Бесплатно

Микоризные агарикоидные базидиомицеты лесопарка «Черняевский» (г. Пермь)

Микоризные агарикоидные базидиомицеты лесопарка «Черняевский» (г. Пермь)

Переведенцева Л.Г., Шилкова Т.А.

Статья научная

На территории лесопарка «Черняевский» (г. Пермь) выявлено 134 вида и внутривидовых таксо­на микоризных агарикоидньгх базидиомицетов. Наряду с типичными бореальными видами в условиях городского парка обитает довольно много неморальных видов. Обнаружены мико­ризные грибы, не встречающиеся в естественных лесных ценозах Пермского края.

Бесплатно

Микробиологический анализ торфяной лечебной грязи месторождения Таборли-3

Микробиологический анализ торфяной лечебной грязи месторождения Таборли-3

Гафарова Л.Ф., Курди У., Яковлева Г.Ю., Колпаков А.И., Ильинская О.Н.

Статья научная

Торфяные грязи (пелоиды) представляют собой природные органоминеральные комплексы, образованные при разложении органических остатков в болотистой местности в условиях недостатка кислорода. Они обладают высокой теплоемкостью и содержат биологически активные вещества (соли, газы, биостимуляторы, метаболиты организмов и пр.), а также живые микроорганизмы. Однако микробный состав пелоидов практически не изучен. Цель работы заключалась в анализе микробного состава торфяных пелоидов месторождения Таборли-3 (Республика Татарстан) согласно санитарно- бактериологическим характеристикам, спектру культивируемых микроорганизмов, молекулярно- генетическому определению прокариотического метагенома и его функционального потенциала. В течение 2021-2023 гг. изучены 7 образцов таборлинских пелоидов. Санитарно-бактериологический анализ осуществляли согласно программе производственного контроля санаториев, применяющих данную грязь. Таксономическую идентификацию выделенных культур микроорганизмов проводили методом времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией MALDI-TOF MS. Молекулярно-генетический анализ сообщества микроорганизмов выполняли секвенированием 16S рРНК с помощью Illumina MiSeq, дальнейщий анализ последовательностей проводили с использованием пакета программного обеспечения Mothur на платформе Galaxy. Охарактеризованы бактериальные сообщества пелоидов, в которых преобладали представители филумов Firmicutes (22%) и Proteobacteria (36%). На уровне семейств доминировали Streptococcaceae, Ruminicoccaceace, Lactobacillaceae, Comamondaceae и Sphingomonadaceae. Функциональный потенциал сообществ подтверждает, что бактерии пелоидов содержат основные гены метаболизма углеводов, липидов, витаминов, аминокислот и нуклеотидов, а также способны утилизировать ксенобиотики. Впервые охарактеризован микробиом лечебных грязей месторождения Таборли-3. Мониторинг состава микробных сообществ лечебных грязей является важной составляющей для оценки вклада микроорганизмов и их метаболитов в оздоровительный эффект пелоидотерапии.

Бесплатно

Микробиологическое состояние документов в фондах библиотеки

Микробиологическое состояние документов в фондах библиотеки

Крестьянникова А.Н., Немойкина А.Л.

Статья научная

Основной задачей архивов, музеев и библиотек во всем мире является сохранение коллекций исторических культурных ценностей. Но на коллекции постоянно оказывают влияние факторы окружающей среды. Среди наиболее важных факторов, влияющих на ухудшение библиотечных материалов, являются биологические, такие как насекомые, грызуны и микроорганизмы. Наибольшую опасность для фондов представляют микроскопические грибы. Наличие спор или фрагментов мицелия на поверхности документов может свидетельствовать о возможной биодеградации в будущем. Мицелий обычно высыхает и быстро теряет жизнеспособность, споры же сохраняются на документах долгое время и при благоприятных условиях начинают прорастать. Сложные биохимические процессы микроскопических грибов приводят к появлению на бумаге пигментных пятен и продуцированию кислот, которые обесцвечивают краски. Кроме нежелательных эстетических аспектов, контаминация некоторыми грибами может привести к необратимой деградации бумаги. В связи с этим важно оценить разнообразие микроскопических грибов на книгах и рукописях. В результате обследования документов в Отделе редких книг Научной библиотеки Томского государственного университета определен состав микромицетов, контаминирую-щих поверхность книг. Основными являются представители родов Aspergillus и Penicillium. Определены микромицеты с высокой целлюлозолитической и кислотообразующей активностью - Mycelia sterile (61%), Aspergillus niger (59%), и Penicillium spp. (57%).

Бесплатно

Микробное разнообразие в глинисто-солевых шламах калийного предприятия (г. Березники, Пермский край)

Микробное разнообразие в глинисто-солевых шламах калийного предприятия (г. Березники, Пермский край)

Корсакова Е.С., Шестакова Е.А., Одинцова Т.А., Бачурин Б.А., Плотникова Е.Г.

Статья научная

Из глинисто-солевых шламов предприятия БКПРУ-2 ПАО «Уралкалий» (г. Березники, Пермский край) выделено 138 штаммов бактерий, которые на основании морфологических и генетических особенностей были объединены в 28 морфогеномогрупп. Представители каждой группы были идентифицированы на основе анализа нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК, сравни-тельное исследование которых показало принадлежность штаммов к классам Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria и Actinobacteria. Все обнаруженные бактерии являются галотолерантными, т.к. способны к росту на средах без добавления NaCl и с повышенной концентрацией соли (до 150 г/л). Большинство штаммов росли в щелочных условиях (рН 9.0) и использовали в качестве един-ственного источника углерода ряд моно- и полиароматических соединений, в том числе полицик-лические ароматические углеводороды, фталаты.

Бесплатно

Микробное сообщество техногенно загрязненного грунта района солеразработок (г. Березники)

Микробное сообщество техногенно загрязненного грунта района солеразработок (г. Березники)

Ястребова О.В., Воронина А.О., Ананьина Л.Н., Корсакова Е.С., Плотникова Е.Г.

Статья научная

С использованием молекулярно-генетических методов проведено исследование структуры микробного сообщества грунта, расположенного вблизи солеотвала БКПРУ-3 предприятия ПАО «Уралкалий» (г. Березники, Пермский край). Методом ПЦР-РВ фрагментов гена 16S рРНК в тотальной ДНК исследуемого образца грунта выявлено наличие бактериальных генов 16S рРНК в количестве 6.6 х 1011 (±8.87 х 107) копий гена на 1 г грунта, а также доминирование грамотрицательных бактерий. ДГГЭ-анализ генов 16S рРНК, амплифицированных с тотальной ДНК, выявил, что бактериальные сообщества накопительных культур, полученных на бифениле и ортио-фталате, существенно различаются между собой, а также отличаются от исходного сообщества образца грунта как по составу, так и наличием доминирующих видов. Установлено, что в полученных НК доминировали грамотрицательные бактерии классов Gammaproteobacteria и Acidobacteria. Методом ДГГЭ-анализа в исследуемом микробном сообществе выявлены «некультивируемые» бактерии рода Halomonas, ранее не обнаруженные культуральны-ми методами.

Бесплатно

Микроклональное размножение Citrus limon (L.) Osbeck сорта Павловский

Микроклональное размножение Citrus limon (L.) Osbeck сорта Павловский

Шибанова Н.Л., Орлова М.В.

Статья научная

Представлены результаты по клональному микроразмножению Citrus limon L. Osbeck сорта Павловский. Установлено, что для стерилизации эксплантов наиболее подходящим является следующий порядок использования стерилизующих агентов: 96% этанол (5 сек.) и 8% раствор гипохлорита натрия (20 мин.). Выход стерильной культуры составил 70%. Для введения лимона сорта Павловский в культуру in vitro оптимальной оказалась твердая питательная среда MS с до-бавлением 1.0 мг/л бензиламинопурина и 0.5 мг/л нафтилуксусной кислоты. Выход жизнеспособ-ных эксплантов составил 77.5%. Культивирование микропобегов проводилось на среде DKW c добавлением фитогормонов 2.0 мг/л бензиламинопурина и 2.0 мг/л гибереллиновой кислоты. С каждого материнского экспланта удалось получить 2.45±0.78 дочерних микропобега. Оптимальной для ризогенеза регенерантов является среда ½ MS с добавлением 1.0 мг/л нафтилуксусной кислоты и 1.0 мг/л индолилуксусной кислоты. Процент укорененных микропобегов составил 65.1. Растения, полученные в культуре in vitro, были перенесены в условия закрытого грунта в почвенный суб-страт: торф, перлит, вермикулит, песок в соотношении 7:2:3:2. Приживаемость растений составила 87.5%.

Бесплатно

Микроклональное размножение Gladiolus х hybridus сорта ‘пермский сувенир’ селекции Учебного ботанического сада ПГНИУ

Микроклональное размножение Gladiolus х hybridus сорта ‘пермский сувенир’ селекции Учебного ботанического сада ПГНИУ

Шибанова Н.Л., Черткова М.А., Чемарова Т.Д.

Статья научная

Представлены результаты микроклонального размножения нового сорта гладиолуса гибридного ‘Пермский Сувенир’. Установлено, что для стерилизации эксплантов оптимальным является следующий порядок использования стерилизующих агентов: 7%-ный раствор гипохлорита натрия с экспозицией 15 или 20-25 мин. и 96%-ный этанол с экспозицией 30 или 60 сек. соответственно для клубнепочек и клубнелуковиц. Выход стерильной культуры при этом составил более 56% для клубнелуковиц и 76% для клубнепочек. На этапе микроразмножения хорошие результаты получены при добавлении к питательной среде Мурасиге и Скуга витаминов (0.1 мг/л тиамина, 0.5 мг/л пиридоксина, 0.5 мг/л никотиновой кислоты) и р-индолилуксусной кислоты (0.1-1 мг/л). Коэффициент размножения составил для клубнепочек - 2-3; для фрагментов клубнелуковиц с апикальной или пазушной почкой - 2-4. Приживаемость растений, переведенных из условий in vitro в in vivo, составила 70%. Диаметр полученных ювенильных клубнелуковиц из культуры in vitro и количество сформированных на них клубнепочек не имели статистически значимых отличий от посаженных in vivo (t = [1.16; 1.22] 05 = 1.96).

Бесплатно

Микроклональное размножение некоторых сортогрупп лилий

Микроклональное размножение некоторых сортогрупп лилий

Шибанова Н.Л., Попкова А.С.

Статья научная

Представлены результаты по микроклональному размножению десяти сортов лилий, относящихся к четырем сортогруппам: восточные, трубчатые, азиатские и лонгифлорум-азиатские гибриды (ЛА-гибриды). Установлено, что для стерилизации эксплантов оптимальным является использование следующих стерилизующих агентов: 7%-ный раствор гипохлорита натрия с экспозицией 20 мин. и 70%-ный этиловый спирт с экспозицией 10 сек. Средний процент выхода стерильной культуры для сортогрупп составил от 66 до 87%. Статистически значимых различий между сортами внутри сортогруппы не выявлено. При микроклональном размножении рекомендуется использовать твердую питательную среду Мурасиге и Скуга с добавлением ауксина а-нафтилуксусная кислота в концентрации 1 мг/л - для сортогрупп восточные, трубчатые и азиатские гибриды или цитокинина 6-бензиламинопурин в концентрации 1 мг/л - для ЛА-гибридов. Процент выхода эксплантов с признаками регенерации составил более 82% для трубчатых и ЛА-гибридов и более 71% - для восточных и азиатских гибридов. По коэффициенту размножения статистически значимых различий между сортами не наблюдается, и для всех изученных сортов любой сортогруппы он может варьировать от 2 до 14 шт./эксплант. Приживаемость растений, переведенных из условий in vitro в in vivo, составила более 60%.

Бесплатно

Микроорганизмы - контаминанты вольеров собак служебных пород и оценка эффективности плановых дезинфекционных мероприятий в кинологическом городке

Микроорганизмы - контаминанты вольеров собак служебных пород и оценка эффективности плановых дезинфекционных мероприятий в кинологическом городке

Крылова И.О., Баландина С.Ю.

Статья научная

Приведены результаты микробиологического исследования вольеров собак служебных пород до и после дезинфекционных мероприятий в учебном комплексе кинологического факультета Пермского военного института войск национальной гвардии РФ. Анализ выявил качественное и количественное разнообразие бактерий, изолированных с внутренних поверхностей вольеров и инвентаря с помощью элективных, дифференциально-диагностических питательных сред. Проведены дезинфекционные мероприятия с применением средства «ЭКОЦИД С», рекомендованного для обработки объектов ветеринарным надзором. Аэрозольное нанесение дезсредства, использованного для обработки вольеров, оказалось низкоэффективным в отношении выделенных микробных изолятов. Предлагаемые рекомендации позволят поддерживать санитарно-гигиенический режим в кинологическом городке при проведении мероприятий текущей и заключительной дезинфекции и будут иметь большое значение в решении вопросов сбережения здоровья и содержания поголовья собак служебных пород.

Бесплатно

Микроэлементы хвои в потомстве культур и естественных популяций ели финской

Микроэлементы хвои в потомстве культур и естественных популяций ели финской

Рогозин Михаил Владимирович, Жекина Наталья Валерьевна, Комаров Вячеслав Сергеевич, Кувшинская Людмила Валентиновна

Статья научная

Проведен анализ содержания 10 микроэлементов (МЭ) в хвое 107 деревьев в 26-летнем возрасте в опытных культурах на суглинистых почвах в потомстве естественных популяций (Е) и культур (К). Вариация содержания МЭ составила в среднем 46.7% с колебаниями от 12 до 133%, и большинство рядов достоверно отличается от нормального распределения Гаусса-Лапласа. Обнаружено, что потомство К, у родителей которого больше признаков ели европейской, меньше накапливает МЭ, имеет меньшую зольность хвои и снижает ее при увеличении зольности почвы (r = -0.38±0.13). Хвоя потомства Е, у родителей которого больше признаков ели сибирской, наоборот, накапливает МЭ, имеет большую зольность и увеличивает ее с увеличением зольности почвы (r = 0.29±0.14).

Бесплатно

Моделирование белковой структуры α-субъединицы бифенил 2,3-диоксигеназы (BphA1) штамма R. wratislaviensis СН628

Моделирование белковой структуры α-субъединицы бифенил 2,3-диоксигеназы (BphA1) штамма R. wratislaviensis СН628

Кирьянова Т.Д.

Статья научная

Выполнено моделирование трёхмерной структуры α-субъединицы бифенил диоксигеназы (BphA1) штамма Rhodococcus wratislaviensis CH628 с использованием программ MODELLER, AlphaFold и trRosetta. Нуклеотидная последовательность гена bphA установлена при анализе полногеномной последовательности штамма в системе RAST. Филогенетический анализ bphAСН628 показал высокую степень сходства с α-субъединицей нафталин диоксигеназы (narA). Для оценки качества полученных моделей использовались программы ERRAT, VERIFY3D и PROCHECK. Модель BphA1СН628 , построенная с помощью MODELLER, продемонстрировала наивысшую структурную точность, в то время как модель BphA1СН628 AlphaFold лучше предсказала активный центр фермента. Анализ активного центра показал консервативность ключевых аминокислот, участвующих в катализе, что подтверждает функциональную схожесть с нафталин диоксигеназой. Полученные результаты открывают перспективы для дальнейшего исследования BphA1 в контексте его применения в биоремедиации.

Бесплатно

Модельные хлорофилл- и хинон-содержащие системы, восстанавливающие кислород и теллурит

Модельные хлорофилл- и хинон-содержащие системы, восстанавливающие кислород и теллурит

Ременников В.Г., Гирва М.В., Белевич И.О.

Статья научная

Установлено, что модельные системы, содержащие хлорофилл а в водном растворе детергента и аскорбата, при освещении способны восстанавливать оксианионы теллурита, что сопровождается почернением среды. Восстановление теллурита, вероятно, происходит по механизму фотооксидазной реакщ1и. Теллурит восстанавливается и в хинон-содержащих модельных системах.

Бесплатно

Модифицирующее действие экстрактов кожицы винограда и красного вина на чувствительность бактерий Escherichia coli к различным антибиотикам

Модифицирующее действие экстрактов кожицы винограда и красного вина на чувствительность бактерий Escherichia coli к различным антибиотикам

Безматерных К.В., Смирнова Г.В., Октябрьский О.Н.

Статья научная

Экстракты красного вина и кожицы винограда содержат значительное количество полифенолов, включая активные антиоксиданты кверцетин и ресвератрол, и проявляют высокую антирадикальную и хелатирующую способность. Внесение экстрактов в культуру E. coli вызывает 30%-ное ин-гибирование скорости роста, индукцию антиоксидантных генов katG и sodA и повышение устойчивости бактерий к перекиси водорода. Предобработка клеток E. coli каждым из экстрактов снижает бактерицидную активность ципрофлоксацина и цефотаксима и, наоборот, усиливает чувствительность бактерий к канамицину и стрептомицину. Воздействие экстрактов осуществляется, по-видимому, путем их влияния на скорость роста бактерий, редокс-статус клеток и уровень экспрессии антиоксидантных генов. В случае ципрофлоксацина, предобработка экстрактами может снижать степень повреждения ДНК и уровень индукции SOS-ответа. Модулирующий эффект экстрактов должен учитываться при антибиотикотерапии.

Бесплатно

Молекулярно - генетический анализ гена CYP11B2, ассоциированного с развитием артериальной гипертензии у дзюдоистов города Перми

Молекулярно - генетический анализ гена CYP11B2, ассоциированного с развитием артериальной гипертензии у дзюдоистов города Перми

Сорокина А.В.

Статья научная

Для корректировки тренировочного процесса важно знать предрасположенность единоборцев к развитию физических качеств, а также сердечно-сосудистых заболеваний, например, артериальной гипертензии. Цель данного исследования - изучение связи полиморфизма гена CYP11B2 (англ. cytochrome P450, family 11, subfamily B, polypeptide 2) с развитием артериальной гипертензии у дзюдоистов школы «Витязь» г. Перми. Выборка для исследований включала 147 человек, распределенных на две группы: Группу I, включающую единоборцев с нормальным давлением, и Группу II, которую составили спортсмены с артериальной гипертензией. У испытуемых в возрасте от 10 до 16 лет проведены исследования с использованием полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ) и выявлен полиморфизм T/C гена CYP11B2 (rs1799998). Корреляционный анализ Спирмена выявил наличие положительной связи (rs=0.597) между показателями генотипа Т/Т гена CYP11B2 у испытуемых и наличием артериальной гипертензии. Данные генетического анализа необходимы в процессе подготовки единоборцев в спортивных школах, т.к. на их основе можно составлять индивидуальные программы тренировок с учетом генотипа и особенностей физической подготовки конкретного спортсмена.

Бесплатно

Молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация редкого вида растений Пермского края Adenophora lilifolia (L.) А. DC

Молекулярно-генетическая идентификация и паспортизация редкого вида растений Пермского края Adenophora lilifolia (L.) А. DC

Боронникова Светлана Витальевна, Нечаева Юлия Сергеевна

Статья научная

Технология молекулярно-генетической идентификации и сертификации была апробирована на четырех популяциях редкого реликтового вида растений Пермского края Adenophora lilifolia (L.) А. DC. Молекулярно-генетический анализ с использованием двух типов молекулярных маркеров на основе ПЦР позволил выявить сочетания специфических фрагментов ДНК. Составлены молекулярно-генетической формулы, штриxкоды и генетические паспорта популяций, даны рекомендации по сохранению популяционных генофондов этого вида.

Бесплатно

Журнал